RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567712.1

CNEP1R1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1 regulatory subunit 1, humanhuman

TSL 4

Gene CNEP1R1, Length 455 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNEP1R1-209ENST00000567712 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.98■■■■■ 6.87
CNEP1R1-209ENST00000567712 ABCC9O60706 1549 aa52.3■■■■■ 5.96
CNEP1R1-209ENST00000567712 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.06■■■■■ 5.92
CNEP1R1-209ENST00000567712 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.61■■■■■ 5.53
CNEP1R1-209ENST00000567712 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.33■■■■■ 5.49
CNEP1R1-209ENST00000567712 NACADO15069 1562 aa49.23■■■■■ 5.47
CNEP1R1-209ENST00000567712 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49■■■■■ 5.43
CNEP1R1-209ENST00000567712 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.7■■■■■ 5.39
CNEP1R1-209ENST00000567712 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.69■■■■■ 5.39
CNEP1R1-209ENST00000567712 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.47■■■■■ 5.35
CNEP1R1-209ENST00000567712 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.32■■■■■ 5.33
CNEP1R1-209ENST00000567712 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.02■■■■■ 5.28
CNEP1R1-209ENST00000567712 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.81■■■■■ 5.24
CNEP1R1-209ENST00000567712 SCRIBQ14160 1630 aa47.5■■■■■ 5.19
CNEP1R1-209ENST00000567712 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.41■■■■■ 5.18
CNEP1R1-209ENST00000567712 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.24■■■■■ 5.15
CNEP1R1-209ENST00000567712 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.08■■■■■ 5.13
CNEP1R1-209ENST00000567712 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
CNEP1R1-209ENST00000567712 NCAPD3P42695 1498 aa45.49■■■■■ 4.87
CNEP1R1-209ENST00000567712 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.36■■■■■ 4.85
CNEP1R1-209ENST00000567712 SMARCA4P51532 1647 aa45.28■■■■■ 4.84
CNEP1R1-209ENST00000567712 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.26■■■■■ 4.84
CNEP1R1-209ENST00000567712 SMARCA2P51531 1590 aa45.14■■■■■ 4.82
CNEP1R1-209ENST00000567712 HMGXB3Q12766 1538 aa45.11■■■■■ 4.81
CNEP1R1-209ENST00000567712 ERCC6Q03468 1493 aa45.05■■■■■ 4.8
CNEP1R1-209ENST00000567712 CUX2O14529 1486 aa45.03■■■■■ 4.8
CNEP1R1-209ENST00000567712 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.95■■■■■ 4.79
CNEP1R1-209ENST00000567712 NESP48681 1621 aa44.93■■■■■ 4.78
CNEP1R1-209ENST00000567712 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
CNEP1R1-209ENST00000567712 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.82■■■■■ 4.76
CNEP1R1-209ENST00000567712 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.74■■■■■ 4.75
CNEP1R1-209ENST00000567712 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
CNEP1R1-209ENST00000567712 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.46■■■■■ 4.71
CNEP1R1-209ENST00000567712 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.35■■■■■ 4.69
CNEP1R1-209ENST00000567712 WIZO95785 1651 aa44.22■■■■■ 4.67
CNEP1R1-209ENST00000567712 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.16■■■■■ 4.66
CNEP1R1-209ENST00000567712 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.09■■■■■ 4.65
CNEP1R1-209ENST00000567712 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.85■■■■■ 4.61
CNEP1R1-209ENST00000567712 WDR62O43379 1518 aa43.78■■■■■ 4.6
CNEP1R1-209ENST00000567712 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
CNEP1R1-209ENST00000567712 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.63■■■■■ 4.57
CNEP1R1-209ENST00000567712 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.6■■■■■ 4.57
CNEP1R1-209ENST00000567712 CFTRP13569 1480 aa43.57■■■■■ 4.56
CNEP1R1-209ENST00000567712 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
CNEP1R1-209ENST00000567712 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.52
CNEP1R1-209ENST00000567712 TRIM41Q8WV44 630 aa43.22■■■■■ 4.51
CNEP1R1-209ENST00000567712 PRDM2Q13029 1718 aa43.17■■■■■ 4.5
CNEP1R1-209ENST00000567712 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.11■■■■■ 4.49
CNEP1R1-209ENST00000567712 OSCARQ8IYS5 282 aa42.96■■■■■ 4.47
CNEP1R1-209ENST00000567712 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.83■■■■■ 4.45
CNEP1R1-209ENST00000567712 TOPBP1Q92547 1522 aa42.79■■■■■ 4.44
CNEP1R1-209ENST00000567712 IFT140Q96RY7 1462 aa42.75■■■■■ 4.43
CNEP1R1-209ENST00000567712 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.58■■■■■ 4.41
CNEP1R1-209ENST00000567712 ABCC8Q09428 1581 aa42.55■■■■■ 4.4
CNEP1R1-209ENST00000567712 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
CNEP1R1-209ENST00000567712 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.52■■■■■ 4.4
CNEP1R1-209ENST00000567712 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.52■■■■■ 4.4
CNEP1R1-209ENST00000567712 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.52■■■■■ 4.4
CNEP1R1-209ENST00000567712 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
CNEP1R1-209ENST00000567712 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.41■■■■■ 4.388e-7■■■□□ 16.1
CNEP1R1-209ENST00000567712 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
CNEP1R1-209ENST00000567712 ARHGEF11O15085 1522 aa42.33■■■■■ 4.37
CNEP1R1-209ENST00000567712 CHD1O14646 1710 aa42.31■■■■■ 4.36
CNEP1R1-209ENST00000567712 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.24■■■■■ 4.35
CNEP1R1-209ENST00000567712 SOGA1O94964 1423 aa42.12■■■■■ 4.33
CNEP1R1-209ENST00000567712 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
CNEP1R1-209ENST00000567712 FBLN2P98095 1184 aa42.08■■■■■ 4.33
CNEP1R1-209ENST00000567712 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.05■■■■■ 4.32
CNEP1R1-209ENST00000567712 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.03■■■■■ 4.32
CNEP1R1-209ENST00000567712 CUX1P39880 1505 aa42.03■■■■■ 4.32
CNEP1R1-209ENST00000567712 ARAP1Q96P48 1450 aa41.94■■■■■ 4.3
CNEP1R1-209ENST00000567712 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.92■■■■■ 4.3
CNEP1R1-209ENST00000567712 WDR97A6NE52 1622 aa41.86■■■■■ 4.29
CNEP1R1-209ENST00000567712 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.77■■■■■ 4.28
CNEP1R1-209ENST00000567712 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
CNEP1R1-209ENST00000567712 GRIN2BQ13224 1484 aa41.73■■■■■ 4.27
CNEP1R1-209ENST00000567712 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
CNEP1R1-209ENST00000567712 PBRM1Q86U86 1689 aa41.65■■■■■ 4.26
CNEP1R1-209ENST00000567712 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
CNEP1R1-209ENST00000567712 SYNJ1O43426 1573 aa41.64■■■■■ 4.26
CNEP1R1-209ENST00000567712 SYNJ2O15056 1496 aa41.62■■■■■ 4.25
CNEP1R1-209ENST00000567712 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.6■■■■■ 4.25
CNEP1R1-209ENST00000567712 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
CNEP1R1-209ENST00000567712 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.54■■■■■ 4.24
CNEP1R1-209ENST00000567712 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.53■■■■■ 4.24
CNEP1R1-209ENST00000567712 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.28■■■■■ 4.2
CNEP1R1-209ENST00000567712 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.28■■■■■ 4.2
CNEP1R1-209ENST00000567712 TOP2BQ02880 1626 aa41.26■■■■■ 4.2
CNEP1R1-209ENST00000567712 GRIN2AQ12879 1464 aa41.23■■■■■ 4.19
CNEP1R1-209ENST00000567712 ADAMTS12P58397 1594 aa41.21■■■■■ 4.19
CNEP1R1-209ENST00000567712 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.21■■■■■ 4.19
CNEP1R1-209ENST00000567712 CEP170Q5SW79 1584 aa41.16■■■■■ 4.18
CNEP1R1-209ENST00000567712 NUP160Q12769 1436 aa41.11■■■■■ 4.17
CNEP1R1-209ENST00000567712 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.03■■■■■ 4.16
CNEP1R1-209ENST00000567712 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.98■■■■■ 4.15
CNEP1R1-209ENST00000567712 SHROOM2Q13796 1616 aa40.98■■■■■ 4.15
CNEP1R1-209ENST00000567712 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
CNEP1R1-209ENST00000567712 JPH4Q96JJ6 628 aa40.68■■■■■ 4.1
CNEP1R1-209ENST00000567712 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.64■■■■■ 4.1
CNEP1R1-209ENST00000567712 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.58■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms