Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms