Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 FOXN3-218ENST00000557718 398 ntTSL 54.93□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 FOXN3-210ENST00000555658 648 ntTSL 33.42□□□□□ -1.862e-6■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 FOXN3-213ENST00000556916 467 ntTSL 33.2□□□□□ -1.92e-6■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 33□□□□□ -1.932e-6■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 SMURF2-207ENST00000585301 1716 ntTSL 511.58□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 SMURF2-203ENST00000578386 3104 ntTSL 1 (best)8.8□□□□□ -12e-8■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 SMURF2-206ENST00000582081 5892 ntTSL 56.13□□□□□ -1.432e-8■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 SMURF2-202ENST00000578200 339 ntTSL 56□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 LINC00534-204ENST00000524361 620 ntTSL 35.22□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.878e-7■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 CSNK2A1-209ENST00000609606 589 ntTSL 212.2□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 CSNK2A1-206ENST00000608066 577 ntTSL 412.2□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 CSNK2A1-205ENST00000460062 552 ntTSL 412.2□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.644e-6■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.014e-6■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.21e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.633e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 UBE2I-208ENST00000473256 1771 ntTSL 214.73□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 UBE2I-218ENST00000568288 501 ntTSL 514.37□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 UBE2I-217ENST00000568209 266 ntTSL 514.34□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 UBE2I-216ENST00000567383 538 ntTSL 413.69□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 UBE2I-210ENST00000562482 735 ntTSL 212.92□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 ZFAND3-202ENST00000373389 531 ntTSL 58.54□□□□□ -1.043e-7■■■■■ 35.3
EXOSC5Q9NQT4 BRD7-201ENST00000394688 5370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 35.2
EXOSC5Q9NQT4 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 35.2
EXOSC5Q9NQT4 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.594e-7■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 SEC22A-208ENST00000487572 870 ntTSL 315.83■□□□□ 0.127e-11■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 SEC22A-205ENST00000477063 759 ntTSL 511.44□□□□□ -0.587e-11■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 SEC22A-203ENST00000466950 565 ntTSL 511.07□□□□□ -0.647e-11■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 SEC22A-210ENST00000492595 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.157e-11■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.337e-11■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 SEC22A-204ENST00000473494 1011 ntTSL 36.27□□□□□ -1.417e-11■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.567e-11■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 UBQLN1-205ENST00000529923 471 ntTSL 22.05□□□□□ -2.086e-7■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.052e-9■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 NCK1-205ENST00000476286 557 ntTSL 412.51□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 NCK1-202ENST00000460960 577 ntTSL 211.9□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 NCK1-206ENST00000478862 794 ntTSL 23.65□□□□□ -1.833e-8■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 C5orf66-201ENST00000505828 561 ntTSL 414.72□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.582e-9■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.052e-9■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-9■■■■■ 35.1
EXOSC5Q9NQT4 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.385e-7■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.395e-7■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 NF1-219ENST00000579081 8788 ntTSL 1 (best)4.76□□□□□ -1.655e-7■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.117e-7■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 MRPS5-207ENST00000482568 711 ntTSL 310.78□□□□□ -0.687e-7■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 MRPS5-202ENST00000345084 1359 ntTSL 29.58□□□□□ -0.887e-7■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 MRPS5-203ENST00000461916 793 ntTSL 28.67□□□□□ -1.027e-7■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.385e-7■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.545e-7■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 RPS6KC1-204ENST00000490299 5154 ntTSL 1 (best)3.5□□□□□ -1.855e-7■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-213ENST00000509357 554 ntTSL 57.03□□□□□ -1.287e-8■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-211ENST00000508531 480 ntTSL 43.97□□□□□ -1.777e-8■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-218ENST00000513341 794 ntTSL 33.22□□□□□ -1.897e-8■■■■■ 35
EXOSC5Q9NQT4 AC139769.1-201ENST00000471224 1001 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.268e-7■■■■■ 34.9
EXOSC5Q9NQT4 AC139769.1-203ENST00000462186 1330 ntTSL 36.12□□□□□ -1.438e-7■■■■■ 34.9
EXOSC5Q9NQT4 AC139769.1-202ENST00000475499 723 ntTSL 33.83□□□□□ -1.88e-7■■■■■ 34.9
EXOSC5Q9NQT4 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC3.83□□□□□ -1.88e-7■■■■■ 34.9
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-222ENST00000635248 3074 ntTSL 58.99□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 34.9
EXOSC5Q9NQT4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.029e-8■■■■■ 34.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF100-206ENST00000608416 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.824e-7■■■■■ 34.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.164e-7■■■■■ 34.8
EXOSC5Q9NQT4 GLMN-206ENST00000495852 891 ntTSL 53.64□□□□□ -1.831e-7■■■■■ 34.8
EXOSC5Q9NQT4 RAP1GAP-203ENST00000374757 1328 ntTSL 519.18■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 34.8
EXOSC5Q9NQT4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 34.8
EXOSC5Q9NQT4 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 34.8
EXOSC5Q9NQT4 RAP1GAP-202ENST00000317967 600 ntTSL 212.31□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 34.8
EXOSC5Q9NQT4 RAP1GAP-213ENST00000611549 4294 ntTSL 512.06□□□□□ -0.485e-7■■■■■ 34.8
EXOSC5Q9NQT4 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.675e-7■■■■■ 34.8
EXOSC5Q9NQT4 RAP1GAP-207ENST00000447293 429 ntTSL 210.54□□□□□ -0.725e-7■■■■■ 34.8
EXOSC5Q9NQT4 RAP1GAP-209ENST00000471600 3238 ntTSL 510.26□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 34.8
EXOSC5Q9NQT4 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 34.8
EXOSC5Q9NQT4 RAP1GAP-212ENST00000542643 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.955e-7■■■■■ 34.8
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