RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543470.5

RPS6KC1-207, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

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Gene RPS6KC1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-207ENST00000543470 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.73■■□□□ 1.87
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RPS6KC1-207ENST00000543470 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1-207ENST00000543470 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
RPS6KC1-207ENST00000543470 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.59■■□□□ 1.37
RPS6KC1-207ENST00000543470 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.37■■□□□ 1.33
RPS6KC1-207ENST00000543470 HRCP23327 699 aa23.31■■□□□ 1.32
RPS6KC1-207ENST00000543470 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.22■■□□□ 1.31
RPS6KC1-207ENST00000543470 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1-207ENST00000543470 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.99■■□□□ 1.27
RPS6KC1-207ENST00000543470 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RPS6KC1-207ENST00000543470 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.78■■□□□ 1.24
RPS6KC1-207ENST00000543470 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1-207ENST00000543470 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1-207ENST00000543470 TRIM41Q8WV44 630 aa22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
RPS6KC1-207ENST00000543470 APLP2Q06481 763 aa22.3■■□□□ 1.16
RPS6KC1-207ENST00000543470 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1-207ENST00000543470 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.16■■□□□ 1.14
RPS6KC1-207ENST00000543470 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RPS6KC1-207ENST00000543470 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1-207ENST00000543470 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1-207ENST00000543470 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1-207ENST00000543470 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.93■■□□□ 1.1
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RPS6KC1-207ENST00000543470 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1-207ENST00000543470 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
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RPS6KC1-207ENST00000543470 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SCRIBQ14160 1630 aa21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1-207ENST00000543470 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1-207ENST00000543470 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1-207ENST00000543470 NEUROD1Q13562 356 aa21.53■■□□□ 1.04
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RPS6KC1-207ENST00000543470 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1-207ENST00000543470 ABCC9O60706 1549 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 NEFLP07196 543 aa21.29■■□□□ 1
RPS6KC1-207ENST00000543470 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.29■■□□□ 1
RPS6KC1-207ENST00000543470 ITGAEP38570 1179 aa21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1-207ENST00000543470 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1-207ENST00000543470 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1-207ENST00000543470 MYT1Q01538 1121 aa21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1-207ENST00000543470 MIER1Q8N108 512 aa21.02■□□□□ 0.96
RPS6KC1-207ENST00000543470 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1-207ENST00000543470 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1-207ENST00000543470 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1-207ENST00000543470 CEP162Q5TB80 1403 aa20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1-207ENST00000543470 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1-207ENST00000543470 SOGA1O94964 1423 aa20.83■□□□□ 0.92
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RPS6KC1-207ENST00000543470 ABCC8Q09428 1581 aa20.8■□□□□ 0.92
RPS6KC1-207ENST00000543470 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.79■□□□□ 0.92
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RPS6KC1-207ENST00000543470 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KC1-207ENST00000543470 GOLGA3Q08378 1498 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KC1-207ENST00000543470 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1-207ENST00000543470 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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RPS6KC1-207ENST00000543470 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.45■□□□□ 0.86
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RPS6KC1-207ENST00000543470 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.38■□□□□ 0.85
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RPS6KC1-207ENST00000543470 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1-207ENST00000543470 TRIM52Q96A61 297 aa20.34■□□□□ 0.85
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RPS6KC1-207ENST00000543470 P3H3Q8IVL6 736 aa20.33■□□□□ 0.84
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RPS6KC1-207ENST00000543470 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1-207ENST00000543470 ANP32CO43423 234 aa20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1-207ENST00000543470 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1-207ENST00000543470 KCNH8Q96L42 1107 aa20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1-207ENST00000543470 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RPS6KC1-207ENST00000543470 SMARCA2P51531 1590 aa20.22■□□□□ 0.83
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RPS6KC1-207ENST00000543470 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1-207ENST00000543470 SMARCA4P51532 1647 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1-207ENST00000543470 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1-207ENST00000543470 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.15■□□□□ 0.82
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RPS6KC1-207ENST00000543470 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1-207ENST00000543470 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1-207ENST00000543470 ARID3CA6NKF2 412 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1-207ENST00000543470 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1-207ENST00000543470 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RPS6KC1-207ENST00000543470 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.04■□□□□ 0.8
RPS6KC1-207ENST00000543470 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
RPS6KC1-207ENST00000543470 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1-207ENST00000543470 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1-207ENST00000543470 KIF21BO75037 1637 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1-207ENST00000543470 TONSLQ96HA7 1378 aa19.94■□□□□ 0.78
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