Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSC4DQ8WTU2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSC4DQ8WTU2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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