Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QL3Q5VWW1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms