Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIN9Q5TKA1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIN9Q5TKA1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIN9Q5TKA1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIN9Q5TKA1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIN9Q5TKA1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIN9Q5TKA1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIN9Q5TKA1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIN9Q5TKA1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms