Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
LIN9Q5TKA1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LIN9Q5TKA1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LIN9Q5TKA1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LIN9Q5TKA1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LIN9Q5TKA1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LIN9Q5TKA1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LIN9Q5TKA1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
LIN9Q5TKA1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LIN9Q5TKA1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LIN9Q5TKA1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LIN9Q5TKA1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LIN9Q5TKA1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LIN9Q5TKA1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LIN9Q5TKA1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LIN9Q5TKA1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LIN9Q5TKA1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LIN9Q5TKA1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LIN9Q5TKA1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LIN9Q5TKA1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LIN9Q5TKA1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LIN9Q5TKA1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LIN9Q5TKA1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
LIN9Q5TKA1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LIN9Q5TKA1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LIN9Q5TKA1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LIN9Q5TKA1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LIN9Q5TKA1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LIN9Q5TKA1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LIN9Q5TKA1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LIN9Q5TKA1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LIN9Q5TKA1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LIN9Q5TKA1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LIN9Q5TKA1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LIN9Q5TKA1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
LIN9Q5TKA1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LIN9Q5TKA1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LIN9Q5TKA1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LIN9Q5TKA1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LIN9Q5TKA1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LIN9Q5TKA1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LIN9Q5TKA1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LIN9Q5TKA1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LIN9Q5TKA1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LIN9Q5TKA1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
LIN9Q5TKA1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LIN9Q5TKA1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LIN9Q5TKA1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LIN9Q5TKA1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
LIN9Q5TKA1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
LIN9Q5TKA1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LIN9Q5TKA1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LIN9Q5TKA1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LIN9Q5TKA1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LIN9Q5TKA1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LIN9Q5TKA1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LIN9Q5TKA1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LIN9Q5TKA1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LIN9Q5TKA1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LIN9Q5TKA1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LIN9Q5TKA1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LIN9Q5TKA1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LIN9Q5TKA1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LIN9Q5TKA1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LIN9Q5TKA1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LIN9Q5TKA1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LIN9Q5TKA1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LIN9Q5TKA1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
LIN9Q5TKA1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LIN9Q5TKA1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
LIN9Q5TKA1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LIN9Q5TKA1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LIN9Q5TKA1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LIN9Q5TKA1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LIN9Q5TKA1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LIN9Q5TKA1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LIN9Q5TKA1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LIN9Q5TKA1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LIN9Q5TKA1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LIN9Q5TKA1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LIN9Q5TKA1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
LIN9Q5TKA1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LIN9Q5TKA1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LIN9Q5TKA1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LIN9Q5TKA1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LIN9Q5TKA1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LIN9Q5TKA1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LIN9Q5TKA1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LIN9Q5TKA1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LIN9Q5TKA1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LIN9Q5TKA1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LIN9Q5TKA1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
LIN9Q5TKA1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LIN9Q5TKA1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LIN9Q5TKA1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LIN9Q5TKA1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LIN9Q5TKA1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LIN9Q5TKA1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LIN9Q5TKA1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LIN9Q5TKA1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms