Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GTSF1Q8WW33 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GTSF1Q8WW33 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GTSF1Q8WW33 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GTSF1Q8WW33 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms