RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296388.9

P3H1-202, Transcript of prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene P3H1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1-202ENST00000296388 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.43■■■■□ 3.1
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P3H1-202ENST00000296388 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.74■■■□□ 2.19
P3H1-202ENST00000296388 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.72■■■□□ 2.19
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P3H1-202ENST00000296388 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.74■■■□□ 2.03
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P3H1-202ENST00000296388 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.9■■□□□ 1.9
P3H1-202ENST00000296388 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.73■■□□□ 1.87
P3H1-202ENST00000296388 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.872e-6■□□□□ 11
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P3H1-202ENST00000296388 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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P3H1-202ENST00000296388 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.11■■□□□ 1.77
P3H1-202ENST00000296388 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
P3H1-202ENST00000296388 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.98■■□□□ 1.75
P3H1-202ENST00000296388 TRIM41Q8WV44 630 aa25.98■■□□□ 1.75
P3H1-202ENST00000296388 SMARCA2P51531 1590 aa25.95■■□□□ 1.74
P3H1-202ENST00000296388 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.93■■□□□ 1.74
P3H1-202ENST00000296388 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.89■■□□□ 1.74
P3H1-202ENST00000296388 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.87■■□□□ 1.73
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P3H1-202ENST00000296388 HMGXB3Q12766 1538 aa25.46■■□□□ 1.67
P3H1-202ENST00000296388 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
P3H1-202ENST00000296388 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.31■■□□□ 1.64
P3H1-202ENST00000296388 SOGA1O94964 1423 aa25.27■■□□□ 1.64
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P3H1-202ENST00000296388 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.19■■□□□ 1.62
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P3H1-202ENST00000296388 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.04■■□□□ 1.6
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P3H1-202ENST00000296388 EEA1Q15075 1411 aa24.97■■□□□ 1.59
P3H1-202ENST00000296388 CUX1P39880 1505 aa24.93■■□□□ 1.58
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P3H1-202ENST00000296388 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.91■■□□□ 1.58
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P3H1-202ENST00000296388 GOLGA3Q08378 1498 aa24.76■■□□□ 1.55
P3H1-202ENST00000296388 CEP162Q5TB80 1403 aa24.76■■□□□ 1.55
P3H1-202ENST00000296388 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.73■■□□□ 1.55
P3H1-202ENST00000296388 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.72■■□□□ 1.55
P3H1-202ENST00000296388 KIF21BO75037 1637 aa24.69■■□□□ 1.54
P3H1-202ENST00000296388 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.68■■□□□ 1.54
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P3H1-202ENST00000296388 KIF27Q86VH2 1401 aa24.6■■□□□ 1.53
P3H1-202ENST00000296388 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.6■■□□□ 1.53
P3H1-202ENST00000296388 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
P3H1-202ENST00000296388 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.56■■□□□ 1.52
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P3H1-202ENST00000296388 CUX2O14529 1486 aa24.53■■□□□ 1.52
P3H1-202ENST00000296388 TOPBP1Q92547 1522 aa24.49■■□□□ 1.51
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P3H1-202ENST00000296388 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.45■■□□□ 1.5
P3H1-202ENST00000296388 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.43■■□□□ 1.5
P3H1-202ENST00000296388 IGF1RP08069 1367 aa24.43■■□□□ 1.5
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P3H1-202ENST00000296388 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
P3H1-202ENST00000296388 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.38■■□□□ 1.49
P3H1-202ENST00000296388 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.3■■□□□ 1.48
P3H1-202ENST00000296388 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.3■■□□□ 1.48
P3H1-202ENST00000296388 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.25■■□□□ 1.47
P3H1-202ENST00000296388 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
P3H1-202ENST00000296388 ARAP1Q96P48 1450 aa24.17■■□□□ 1.46
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P3H1-202ENST00000296388 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
P3H1-202ENST00000296388 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.11■■□□□ 1.45
P3H1-202ENST00000296388 NEUROD1Q13562 356 aa24.1■■□□□ 1.45
P3H1-202ENST00000296388 APLP2Q06481 763 aa24.09■■□□□ 1.45
P3H1-202ENST00000296388 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
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P3H1-202ENST00000296388 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.07■■□□□ 1.44
P3H1-202ENST00000296388 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
P3H1-202ENST00000296388 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.06■■□□□ 1.44
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