Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTSF1Q8WW33 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTSF1Q8WW33 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTSF1Q8WW33 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTSF1Q8WW33 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTSF1Q8WW33 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTSF1Q8WW33 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTSF1Q8WW33 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTSF1Q8WW33 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTSF1Q8WW33 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTSF1Q8WW33 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTSF1Q8WW33 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GTSF1Q8WW33 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTSF1Q8WW33 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTSF1Q8WW33 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTSF1Q8WW33 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTSF1Q8WW33 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTSF1Q8WW33 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTSF1Q8WW33 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTSF1Q8WW33 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTSF1Q8WW33 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTSF1Q8WW33 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTSF1Q8WW33 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTSF1Q8WW33 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTSF1Q8WW33 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTSF1Q8WW33 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTSF1Q8WW33 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTSF1Q8WW33 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTSF1Q8WW33 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTSF1Q8WW33 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTSF1Q8WW33 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTSF1Q8WW33 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTSF1Q8WW33 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTSF1Q8WW33 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTSF1Q8WW33 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTSF1Q8WW33 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTSF1Q8WW33 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTSF1Q8WW33 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTSF1Q8WW33 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTSF1Q8WW33 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTSF1Q8WW33 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTSF1Q8WW33 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTSF1Q8WW33 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTSF1Q8WW33 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTSF1Q8WW33 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTSF1Q8WW33 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTSF1Q8WW33 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTSF1Q8WW33 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTSF1Q8WW33 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTSF1Q8WW33 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTSF1Q8WW33 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTSF1Q8WW33 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTSF1Q8WW33 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTSF1Q8WW33 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTSF1Q8WW33 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTSF1Q8WW33 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTSF1Q8WW33 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTSF1Q8WW33 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTSF1Q8WW33 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTSF1Q8WW33 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTSF1Q8WW33 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTSF1Q8WW33 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTSF1Q8WW33 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTSF1Q8WW33 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTSF1Q8WW33 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTSF1Q8WW33 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTSF1Q8WW33 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTSF1Q8WW33 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTSF1Q8WW33 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTSF1Q8WW33 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTSF1Q8WW33 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTSF1Q8WW33 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTSF1Q8WW33 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTSF1Q8WW33 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTSF1Q8WW33 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTSF1Q8WW33 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTSF1Q8WW33 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTSF1Q8WW33 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTSF1Q8WW33 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTSF1Q8WW33 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTSF1Q8WW33 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTSF1Q8WW33 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTSF1Q8WW33 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTSF1Q8WW33 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTSF1Q8WW33 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTSF1Q8WW33 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTSF1Q8WW33 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTSF1Q8WW33 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTSF1Q8WW33 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTSF1Q8WW33 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTSF1Q8WW33 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTSF1Q8WW33 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTSF1Q8WW33 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTSF1Q8WW33 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTSF1Q8WW33 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTSF1Q8WW33 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTSF1Q8WW33 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTSF1Q8WW33 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GTSF1Q8WW33 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTSF1Q8WW33 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms