Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms