RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301272.6

TMIGD2-201, Transcript of transmembrane and immunoglobulin domain containing 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIGD2, Length 1,262 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2-201ENST00000301272 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.93■■■■■ 5.1
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TMIGD2-201ENST00000301272 ABCC9O60706 1549 aa40.89■■■■■ 4.14
TMIGD2-201ENST00000301272 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.29■■■■□ 3.88
TMIGD2-201ENST00000301272 NACADO15069 1562 aa39.25■■■■□ 3.87
TMIGD2-201ENST00000301272 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
TMIGD2-201ENST00000301272 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.04■■■■□ 3.84
TMIGD2-201ENST00000301272 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.89■■■■□ 3.82
TMIGD2-201ENST00000301272 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.85■■■■□ 3.81
TMIGD2-201ENST00000301272 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.61■■■■□ 3.77
TMIGD2-201ENST00000301272 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.31■■■■□ 3.72
TMIGD2-201ENST00000301272 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.13■■■■□ 3.69
TMIGD2-201ENST00000301272 SCRIBQ14160 1630 aa38.07■■■■□ 3.68
TMIGD2-201ENST00000301272 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.73■■■■□ 3.63
TMIGD2-201ENST00000301272 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.73■■■■□ 3.63
TMIGD2-201ENST00000301272 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
TMIGD2-201ENST00000301272 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.06■■■■□ 3.52
TMIGD2-201ENST00000301272 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.74■■■■□ 3.47
TMIGD2-201ENST00000301272 SMARCA4P51532 1647 aa36.46■■■■□ 3.43
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TMIGD2-201ENST00000301272 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.25■■■■□ 3.39
TMIGD2-201ENST00000301272 NCAPD3P42695 1498 aa36.24■■■■□ 3.39
TMIGD2-201ENST00000301272 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.2■■■■□ 3.39
TMIGD2-201ENST00000301272 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.16■■■■□ 3.38
TMIGD2-201ENST00000301272 SMARCA2P51531 1590 aa36.14■■■■□ 3.38
TMIGD2-201ENST00000301272 HMGXB3Q12766 1538 aa36.08■■■■□ 3.37
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TMIGD2-201ENST00000301272 WIZO95785 1651 aa35.8■■■■□ 3.32
TMIGD2-201ENST00000301272 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
TMIGD2-201ENST00000301272 NESP48681 1621 aa35.44■■■■□ 3.26
TMIGD2-201ENST00000301272 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
TMIGD2-201ENST00000301272 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.28■■■■□ 3.24
TMIGD2-201ENST00000301272 ERCC6Q03468 1493 aa35.12■■■■□ 3.21
TMIGD2-201ENST00000301272 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.12■■■■□ 3.21
TMIGD2-201ENST00000301272 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.05■■■■□ 3.2
TMIGD2-201ENST00000301272 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
TMIGD2-201ENST00000301272 CFTRP13569 1480 aa34.96■■■■□ 3.19
TMIGD2-201ENST00000301272 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.95■■■■□ 3.19
TMIGD2-201ENST00000301272 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.93■■■■□ 3.18
TMIGD2-201ENST00000301272 CUX2O14529 1486 aa34.9■■■■□ 3.18
TMIGD2-201ENST00000301272 PRDM2Q13029 1718 aa34.75■■■■□ 3.15
TMIGD2-201ENST00000301272 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.72■■■■□ 3.15
TMIGD2-201ENST00000301272 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.71■■■■□ 3.15
TMIGD2-201ENST00000301272 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.66■■■■□ 3.14
TMIGD2-201ENST00000301272 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.66■■■■□ 3.14
TMIGD2-201ENST00000301272 WDR62O43379 1518 aa34.64■■■■□ 3.14
TMIGD2-201ENST00000301272 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
TMIGD2-201ENST00000301272 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
TMIGD2-201ENST00000301272 TOPBP1Q92547 1522 aa34.21■■■■□ 3.07
TMIGD2-201ENST00000301272 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.15■■■■□ 3.06
TMIGD2-201ENST00000301272 ABCC8Q09428 1581 aa34.07■■■■□ 3.05
TMIGD2-201ENST00000301272 CUX1P39880 1505 aa33.96■■■■□ 3.03
TMIGD2-201ENST00000301272 IFT140Q96RY7 1462 aa33.95■■■■□ 3.02
TMIGD2-201ENST00000301272 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
TMIGD2-201ENST00000301272 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
TMIGD2-201ENST00000301272 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
TMIGD2-201ENST00000301272 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.8■■■■□ 3
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TMIGD2-201ENST00000301272 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.76■■■■□ 3
TMIGD2-201ENST00000301272 WDR97A6NE52 1622 aa33.68■■■□□ 2.98
TMIGD2-201ENST00000301272 SOGA1O94964 1423 aa33.67■■■□□ 2.98
TMIGD2-201ENST00000301272 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.66■■■□□ 2.98
TMIGD2-201ENST00000301272 SYNJ1O43426 1573 aa33.64■■■□□ 2.98
TMIGD2-201ENST00000301272 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.63■■■□□ 2.97
TMIGD2-201ENST00000301272 TOP2BQ02880 1626 aa33.62■■■□□ 2.97
TMIGD2-201ENST00000301272 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.58■■■□□ 2.97
TMIGD2-201ENST00000301272 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.96
TMIGD2-201ENST00000301272 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.48■■■□□ 2.95
TMIGD2-201ENST00000301272 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.43■■■□□ 2.94
TMIGD2-201ENST00000301272 CHD1O14646 1710 aa33.37■■■□□ 2.93
TMIGD2-201ENST00000301272 PBRM1Q86U86 1689 aa33.36■■■□□ 2.93
TMIGD2-201ENST00000301272 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.32■■■□□ 2.92
TMIGD2-201ENST00000301272 GRIN2BQ13224 1484 aa33.31■■■□□ 2.92
TMIGD2-201ENST00000301272 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.31■■■□□ 2.92
TMIGD2-201ENST00000301272 OSCARQ8IYS5 282 aa33.29■■■□□ 2.92
TMIGD2-201ENST00000301272 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
TMIGD2-201ENST00000301272 SYNJ2O15056 1496 aa33.13■■■□□ 2.89
TMIGD2-201ENST00000301272 TRIM41Q8WV44 630 aa33.1■■■□□ 2.89
TMIGD2-201ENST00000301272 ADAMTS12P58397 1594 aa33.09■■■□□ 2.89
TMIGD2-201ENST00000301272 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.06■■■□□ 2.88
TMIGD2-201ENST00000301272 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.04■■■□□ 2.88
TMIGD2-201ENST00000301272 FBLN2P98095 1184 aa33.02■■■□□ 2.88
TMIGD2-201ENST00000301272 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.99■■■□□ 2.87
TMIGD2-201ENST00000301272 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.99■■■□□ 2.87
TMIGD2-201ENST00000301272 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.99■■■□□ 2.87
TMIGD2-201ENST00000301272 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.87
TMIGD2-201ENST00000301272 ARHGEF11O15085 1522 aa32.95■■■□□ 2.87
TMIGD2-201ENST00000301272 GRIN2AQ12879 1464 aa32.93■■■□□ 2.86
TMIGD2-201ENST00000301272 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.91■■■□□ 2.86
TMIGD2-201ENST00000301272 CEP170Q5SW79 1584 aa32.85■■■□□ 2.85
TMIGD2-201ENST00000301272 NUP160Q12769 1436 aa32.84■■■□□ 2.85
TMIGD2-201ENST00000301272 KIF27Q86VH2 1401 aa32.83■■■□□ 2.85
TMIGD2-201ENST00000301272 IGF1RP08069 1367 aa32.81■■■□□ 2.84
TMIGD2-201ENST00000301272 CUL7Q14999 1698 aa32.73■■■□□ 2.83
TMIGD2-201ENST00000301272 ARAP1Q96P48 1450 aa32.72■■■□□ 2.83
TMIGD2-201ENST00000301272 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.68■■■□□ 2.82
TMIGD2-201ENST00000301272 SHROOM2Q13796 1616 aa32.66■■■□□ 2.82
TMIGD2-201ENST00000301272 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.61■■■□□ 2.81
TMIGD2-201ENST00000301272 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.54■■■□□ 2.8
TMIGD2-201ENST00000301272 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.47■■■□□ 2.79
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