RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271331.3

PROK1-201, Transcript of prokineticin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PROK1, Length 1,338 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1-201ENST00000271331 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.65■■■■■ 4.26
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PROK1-201ENST00000271331 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.96■■■■□ 3.19
PROK1-201ENST00000271331 NACADO15069 1562 aa34.88■■■■□ 3.17
PROK1-201ENST00000271331 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
PROK1-201ENST00000271331 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.64■■■■□ 3.14
PROK1-201ENST00000271331 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.59■■■■□ 3.13
PROK1-201ENST00000271331 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.51■■■■□ 3.11
PROK1-201ENST00000271331 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.34■■■■□ 3.09
PROK1-201ENST00000271331 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.99■■■■□ 3.03
PROK1-201ENST00000271331 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.88■■■■□ 3.01
PROK1-201ENST00000271331 SCRIBQ14160 1630 aa33.71■■■□□ 2.99
PROK1-201ENST00000271331 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.67■■■□□ 2.98
PROK1-201ENST00000271331 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.59■■■□□ 2.97
PROK1-201ENST00000271331 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
PROK1-201ENST00000271331 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33■■■□□ 2.87
PROK1-201ENST00000271331 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.75■■■□□ 2.83
PROK1-201ENST00000271331 SMARCA4P51532 1647 aa32.28■■■□□ 2.76
PROK1-201ENST00000271331 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
PROK1-201ENST00000271331 NCAPD3P42695 1498 aa32.17■■■□□ 2.74
PROK1-201ENST00000271331 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.12■■■□□ 2.73
PROK1-201ENST00000271331 SMARCA2P51531 1590 aa32.09■■■□□ 2.73
PROK1-201ENST00000271331 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.08■■■□□ 2.73
PROK1-201ENST00000271331 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.02■■■□□ 2.72
PROK1-201ENST00000271331 HMGXB3Q12766 1538 aa32.02■■■□□ 2.72
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PROK1-201ENST00000271331 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
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PROK1-201ENST00000271331 NESP48681 1621 aa31.45■■■□□ 2.62
PROK1-201ENST00000271331 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.39■■■□□ 2.62
PROK1-201ENST00000271331 ERCC6Q03468 1493 aa31.34■■■□□ 2.61
PROK1-201ENST00000271331 CUX2O14529 1486 aa31.22■■■□□ 2.59
PROK1-201ENST00000271331 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.17■■■□□ 2.58
PROK1-201ENST00000271331 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.16■■■□□ 2.58
PROK1-201ENST00000271331 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
PROK1-201ENST00000271331 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.12■■■□□ 2.57
PROK1-201ENST00000271331 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.1■■■□□ 2.57
PROK1-201ENST00000271331 CFTRP13569 1480 aa30.98■■■□□ 2.55
PROK1-201ENST00000271331 PRDM2Q13029 1718 aa30.87■■■□□ 2.53
PROK1-201ENST00000271331 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.83■■■□□ 2.53
PROK1-201ENST00000271331 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.81■■■□□ 2.52
PROK1-201ENST00000271331 WDR62O43379 1518 aa30.8■■■□□ 2.52
PROK1-201ENST00000271331 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.79■■■□□ 2.52
PROK1-201ENST00000271331 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
PROK1-201ENST00000271331 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.52■■■□□ 2.48
PROK1-201ENST00000271331 TOPBP1Q92547 1522 aa30.31■■■□□ 2.44
PROK1-201ENST00000271331 ABCC8Q09428 1581 aa30.29■■■□□ 2.44
PROK1-201ENST00000271331 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.29■■■□□ 2.44
PROK1-201ENST00000271331 IFT140Q96RY7 1462 aa30.18■■■□□ 2.42
PROK1-201ENST00000271331 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
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PROK1-201ENST00000271331 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.07■■■□□ 2.4
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PROK1-201ENST00000271331 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.04■■■□□ 2.4
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PROK1-201ENST00000271331 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.87■■■□□ 2.37
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PROK1-201ENST00000271331 WDR97A6NE52 1622 aa29.84■■■□□ 2.37
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PROK1-201ENST00000271331 CHD1O14646 1710 aa29.71■■■□□ 2.35
PROK1-201ENST00000271331 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
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PROK1-201ENST00000271331 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.6■■■□□ 2.33
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PROK1-201ENST00000271331 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.56■■■□□ 2.32
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PROK1-201ENST00000271331 EEA1Q15075 1411 aa29.47■■■□□ 2.31
PROK1-201ENST00000271331 KIF27Q86VH2 1401 aa29.46■■■□□ 2.31
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PROK1-201ENST00000271331 SYNJ2O15056 1496 aa29.42■■■□□ 2.3
PROK1-201ENST00000271331 ARHGEF11O15085 1522 aa29.38■■■□□ 2.29
PROK1-201ENST00000271331 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.38■■■□□ 2.29
PROK1-201ENST00000271331 FBLN2P98095 1184 aa29.38■■■□□ 2.29
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PROK1-201ENST00000271331 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.24■■■□□ 2.27
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PROK1-201ENST00000271331 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
PROK1-201ENST00000271331 CUL7Q14999 1698 aa29.18■■■□□ 2.26
PROK1-201ENST00000271331 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.18■■■□□ 2.26
PROK1-201ENST00000271331 ARAP1Q96P48 1450 aa29.13■■■□□ 2.25
PROK1-201ENST00000271331 PRXQ9BXM0 1461 aa29.12■■■□□ 2.25
PROK1-201ENST00000271331 NUP160Q12769 1436 aa29.12■■■□□ 2.25
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