RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292408.8

FGFR4-201, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGFR4, Length 3,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-201ENST00000292408 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.17■■■□□ 2.74
FGFR4-201ENST00000292408 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.83■■■□□ 2.21
FGFR4-201ENST00000292408 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
FGFR4-201ENST00000292408 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.87■■■□□ 2.05
FGFR4-201ENST00000292408 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.45■■□□□ 1.98
FGFR4-201ENST00000292408 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.43■■□□□ 1.98
FGFR4-201ENST00000292408 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.41■■□□□ 1.98
FGFR4-201ENST00000292408 HRCP23327 699 aa27.3■■□□□ 1.96
FGFR4-201ENST00000292408 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
FGFR4-201ENST00000292408 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
FGFR4-201ENST00000292408 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.07■■□□□ 1.92
FGFR4-201ENST00000292408 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.66■■□□□ 1.86
FGFR4-201ENST00000292408 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.62■■□□□ 1.85
FGFR4-201ENST00000292408 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
FGFR4-201ENST00000292408 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
FGFR4-201ENST00000292408 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.28■■□□□ 1.8
FGFR4-201ENST00000292408 TRIM41Q8WV44 630 aa26.19■■□□□ 1.78
FGFR4-201ENST00000292408 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
FGFR4-201ENST00000292408 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
FGFR4-201ENST00000292408 SCRIBQ14160 1630 aa25.84■■□□□ 1.73
FGFR4-201ENST00000292408 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
FGFR4-201ENST00000292408 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
FGFR4-201ENST00000292408 ABCC9O60706 1549 aa25.68■■□□□ 1.7
FGFR4-201ENST00000292408 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
FGFR4-201ENST00000292408 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.65■■□□□ 1.7
FGFR4-201ENST00000292408 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
FGFR4-201ENST00000292408 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
FGFR4-201ENST00000292408 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.47■■□□□ 1.67
FGFR4-201ENST00000292408 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.26■■□□□ 1.63
FGFR4-201ENST00000292408 NEUROD1Q13562 356 aa25.22■■□□□ 1.63
FGFR4-201ENST00000292408 WIZO95785 1651 aa25.13■■□□□ 1.61
FGFR4-201ENST00000292408 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
FGFR4-201ENST00000292408 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
FGFR4-201ENST00000292408 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
FGFR4-201ENST00000292408 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.04■■□□□ 1.6
FGFR4-201ENST00000292408 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
FGFR4-201ENST00000292408 MYT1Q01538 1121 aa24.98■■□□□ 1.59
FGFR4-201ENST00000292408 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
FGFR4-201ENST00000292408 ABCC8Q09428 1581 aa24.94■■□□□ 1.58
FGFR4-201ENST00000292408 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.9■■□□□ 1.58
FGFR4-201ENST00000292408 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
FGFR4-201ENST00000292408 SOGA1O94964 1423 aa24.86■■□□□ 1.57
FGFR4-201ENST00000292408 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
FGFR4-201ENST00000292408 CEP162Q5TB80 1403 aa24.8■■□□□ 1.56
FGFR4-201ENST00000292408 NACADO15069 1562 aa24.76■■□□□ 1.55
FGFR4-201ENST00000292408 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.75■■□□□ 1.55
FGFR4-201ENST00000292408 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.75■■□□□ 1.55
FGFR4-201ENST00000292408 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.555e-7■□□□□ 10.2
FGFR4-201ENST00000292408 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
FGFR4-201ENST00000292408 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
FGFR4-201ENST00000292408 MIER1Q8N108 512 aa24.61■■□□□ 1.53
FGFR4-201ENST00000292408 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.55■■□□□ 1.52
FGFR4-201ENST00000292408 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
FGFR4-201ENST00000292408 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
FGFR4-201ENST00000292408 APLP2Q06481 763 aa24.45■■□□□ 1.5
FGFR4-201ENST00000292408 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
FGFR4-201ENST00000292408 SMARCA2P51531 1590 aa24.43■■□□□ 1.5
FGFR4-201ENST00000292408 SMARCA4P51532 1647 aa24.36■■□□□ 1.49
FGFR4-201ENST00000292408 GOLGA3Q08378 1498 aa24.32■■□□□ 1.48
FGFR4-201ENST00000292408 CLIP1P30622 1438 aa24.28■■□□□ 1.48
FGFR4-201ENST00000292408 ITGAEP38570 1179 aa24.23■■□□□ 1.47
FGFR4-201ENST00000292408 EEA1Q15075 1411 aa24.21■■□□□ 1.47
FGFR4-201ENST00000292408 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.12■■□□□ 1.45
FGFR4-201ENST00000292408 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.1■■□□□ 1.45
FGFR4-201ENST00000292408 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
FGFR4-201ENST00000292408 SYNJ1O43426 1573 aa24.07■■□□□ 1.44
FGFR4-201ENST00000292408 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.05■■□□□ 1.44
FGFR4-201ENST00000292408 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.99■■□□□ 1.43
FGFR4-201ENST00000292408 KCNH8Q96L42 1107 aa23.92■■□□□ 1.42
FGFR4-201ENST00000292408 BCL11AQ9H165 835 aa23.92■■□□□ 1.42
FGFR4-201ENST00000292408 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
FGFR4-201ENST00000292408 KIF21BO75037 1637 aa23.88■■□□□ 1.41
FGFR4-201ENST00000292408 BCANQ96GW7 911 aa23.86■■□□□ 1.41
FGFR4-201ENST00000292408 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
FGFR4-201ENST00000292408 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.4
FGFR4-201ENST00000292408 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
FGFR4-201ENST00000292408 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.8■■□□□ 1.4
FGFR4-201ENST00000292408 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.79■■□□□ 1.4
FGFR4-201ENST00000292408 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
FGFR4-201ENST00000292408 P3H3Q8IVL6 736 aa23.71■■□□□ 1.39
FGFR4-201ENST00000292408 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
FGFR4-201ENST00000292408 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.67■■□□□ 1.38
FGFR4-201ENST00000292408 ARAP1Q96P48 1450 aa23.67■■□□□ 1.38
FGFR4-201ENST00000292408 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
FGFR4-201ENST00000292408 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
FGFR4-201ENST00000292408 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.58■■□□□ 1.37
FGFR4-201ENST00000292408 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.58■■□□□ 1.37
FGFR4-201ENST00000292408 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.57■■□□□ 1.36
FGFR4-201ENST00000292408 FKBP8Q14318 412 aa23.53■■□□□ 1.36
FGFR4-201ENST00000292408 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.53■■□□□ 1.36
FGFR4-201ENST00000292408 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.53■■□□□ 1.36
FGFR4-201ENST00000292408 PRXQ9BXM0 1461 aa23.53■■□□□ 1.36
FGFR4-201ENST00000292408 TRIM52Q96A61 297 aa23.52■■□□□ 1.36
FGFR4-201ENST00000292408 TOP2BQ02880 1626 aa23.5■■□□□ 1.35
FGFR4-201ENST00000292408 KIF27Q86VH2 1401 aa23.47■■□□□ 1.35
FGFR4-201ENST00000292408 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
FGFR4-201ENST00000292408 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.43■■□□□ 1.34
FGFR4-201ENST00000292408 CUX1P39880 1505 aa23.41■■□□□ 1.34
FGFR4-201ENST00000292408 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.34■■□□□ 1.33
FGFR4-201ENST00000292408 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms