Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB1Q9Y478 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKAB1Q9Y478 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB1Q9Y478 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB1Q9Y478 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB1Q9Y478 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB1Q9Y478 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB1Q9Y478 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB1Q9Y478 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB1Q9Y478 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms