Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRKAB1Q9Y478 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRKAB1Q9Y478 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRKAB1Q9Y478 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PRKAB1Q9Y478 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRKAB1Q9Y478 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRKAB1Q9Y478 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRKAB1Q9Y478 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRKAB1Q9Y478 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRKAB1Q9Y478 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRKAB1Q9Y478 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRKAB1Q9Y478 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRKAB1Q9Y478 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRKAB1Q9Y478 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRKAB1Q9Y478 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRKAB1Q9Y478 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRKAB1Q9Y478 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRKAB1Q9Y478 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRKAB1Q9Y478 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PRKAB1Q9Y478 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRKAB1Q9Y478 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRKAB1Q9Y478 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRKAB1Q9Y478 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRKAB1Q9Y478 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRKAB1Q9Y478 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRKAB1Q9Y478 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRKAB1Q9Y478 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PRKAB1Q9Y478 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKAB1Q9Y478 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKAB1Q9Y478 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRKAB1Q9Y478 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRKAB1Q9Y478 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRKAB1Q9Y478 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRKAB1Q9Y478 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRKAB1Q9Y478 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PRKAB1Q9Y478 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRKAB1Q9Y478 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKAB1Q9Y478 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKAB1Q9Y478 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRKAB1Q9Y478 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRKAB1Q9Y478 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRKAB1Q9Y478 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRKAB1Q9Y478 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKAB1Q9Y478 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRKAB1Q9Y478 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRKAB1Q9Y478 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRKAB1Q9Y478 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKAB1Q9Y478 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKAB1Q9Y478 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKAB1Q9Y478 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKAB1Q9Y478 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKAB1Q9Y478 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKAB1Q9Y478 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKAB1Q9Y478 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKAB1Q9Y478 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKAB1Q9Y478 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKAB1Q9Y478 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKAB1Q9Y478 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRKAB1Q9Y478 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKAB1Q9Y478 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKAB1Q9Y478 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKAB1Q9Y478 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKAB1Q9Y478 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKAB1Q9Y478 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKAB1Q9Y478 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKAB1Q9Y478 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKAB1Q9Y478 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKAB1Q9Y478 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKAB1Q9Y478 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKAB1Q9Y478 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKAB1Q9Y478 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKAB1Q9Y478 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKAB1Q9Y478 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKAB1Q9Y478 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKAB1Q9Y478 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKAB1Q9Y478 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKAB1Q9Y478 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKAB1Q9Y478 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRKAB1Q9Y478 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKAB1Q9Y478 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKAB1Q9Y478 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKAB1Q9Y478 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKAB1Q9Y478 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKAB1Q9Y478 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKAB1Q9Y478 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKAB1Q9Y478 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKAB1Q9Y478 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKAB1Q9Y478 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKAB1Q9Y478 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKAB1Q9Y478 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKAB1Q9Y478 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKAB1Q9Y478 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKAB1Q9Y478 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKAB1Q9Y478 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKAB1Q9Y478 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKAB1Q9Y478 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKAB1Q9Y478 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKAB1Q9Y478 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKAB1Q9Y478 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKAB1Q9Y478 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms