Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBGCP4Q9UGJ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBGCP4Q9UGJ1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms