Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYOFQ9NZM1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYOFQ9NZM1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms