Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM30AQ9NV96 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM30AQ9NV96 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM30AQ9NV96 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms