Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HGDQ93099 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HGDQ93099 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HGDQ93099 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HGDQ93099 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HGDQ93099 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HGDQ93099 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HGDQ93099 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HGDQ93099 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HGDQ93099 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HGDQ93099 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HGDQ93099 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HGDQ93099 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HGDQ93099 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HGDQ93099 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HGDQ93099 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HGDQ93099 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HGDQ93099 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HGDQ93099 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HGDQ93099 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HGDQ93099 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HGDQ93099 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HGDQ93099 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HGDQ93099 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HGDQ93099 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HGDQ93099 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HGDQ93099 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HGDQ93099 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HGDQ93099 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HGDQ93099 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HGDQ93099 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HGDQ93099 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HGDQ93099 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HGDQ93099 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HGDQ93099 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HGDQ93099 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HGDQ93099 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HGDQ93099 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HGDQ93099 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HGDQ93099 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HGDQ93099 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HGDQ93099 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HGDQ93099 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HGDQ93099 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HGDQ93099 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HGDQ93099 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HGDQ93099 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HGDQ93099 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HGDQ93099 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HGDQ93099 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HGDQ93099 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HGDQ93099 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HGDQ93099 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HGDQ93099 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HGDQ93099 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HGDQ93099 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HGDQ93099 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HGDQ93099 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HGDQ93099 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HGDQ93099 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HGDQ93099 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HGDQ93099 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HGDQ93099 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HGDQ93099 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HGDQ93099 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HGDQ93099 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HGDQ93099 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HGDQ93099 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HGDQ93099 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HGDQ93099 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HGDQ93099 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HGDQ93099 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HGDQ93099 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HGDQ93099 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HGDQ93099 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HGDQ93099 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HGDQ93099 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HGDQ93099 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HGDQ93099 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HGDQ93099 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HGDQ93099 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HGDQ93099 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HGDQ93099 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HGDQ93099 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HGDQ93099 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HGDQ93099 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HGDQ93099 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HGDQ93099 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HGDQ93099 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HGDQ93099 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HGDQ93099 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HGDQ93099 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HGDQ93099 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HGDQ93099 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HGDQ93099 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HGDQ93099 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HGDQ93099 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HGDQ93099 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HGDQ93099 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HGDQ93099 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms