RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617962.1

GADD45A-205, Transcript of growth arrest and DNA damage inducible alpha, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45A, Length 1,142 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45A-205ENST00000617962 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.82■■■■■ 7.49
GADD45A-205ENST00000617962 ABCC9O60706 1549 aa55.81■■■■■ 6.52
GADD45A-205ENST00000617962 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.54■■■■■ 6.48
GADD45A-205ENST00000617962 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.99■■■■■ 6.07
GADD45A-205ENST00000617962 NACADO15069 1562 aa52.57■■■■■ 6.01
GADD45A-205ENST00000617962 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.54■■■■■ 6
GADD45A-205ENST00000617962 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.33■■■■■ 5.97
GADD45A-205ENST00000617962 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.93■■■■■ 5.9
GADD45A-205ENST00000617962 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.8■■■■■ 5.88
GADD45A-205ENST00000617962 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.74■■■■■ 5.87
GADD45A-205ENST00000617962 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.47■■■■■ 5.83
GADD45A-205ENST00000617962 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.19■■■■■ 5.79
GADD45A-205ENST00000617962 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.03■■■■■ 5.76
GADD45A-205ENST00000617962 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.71■■■■■ 5.71
GADD45A-205ENST00000617962 SCRIBQ14160 1630 aa50.65■■■■■ 5.7
GADD45A-205ENST00000617962 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.38■■■■■ 5.66
GADD45A-205ENST00000617962 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.27■■■■■ 5.64
GADD45A-205ENST00000617962 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.21■■■■■ 5.63
GADD45A-205ENST00000617962 NCAPD3P42695 1498 aa48.54■■■■■ 5.36
GADD45A-205ENST00000617962 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.37■■■■■ 5.33
GADD45A-205ENST00000617962 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.37■■■■■ 5.33
GADD45A-205ENST00000617962 SMARCA4P51532 1647 aa48.28■■■■■ 5.32
GADD45A-205ENST00000617962 SMARCA2P51531 1590 aa48.22■■■■■ 5.31
GADD45A-205ENST00000617962 ERCC6Q03468 1493 aa48.19■■■■■ 5.31
GADD45A-205ENST00000617962 HMGXB3Q12766 1538 aa48.16■■■■■ 5.3
GADD45A-205ENST00000617962 CUX2O14529 1486 aa48.14■■■■■ 5.3
GADD45A-205ENST00000617962 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48■■■■■ 5.27
GADD45A-205ENST00000617962 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.91■■■■■ 5.26
GADD45A-205ENST00000617962 NESP48681 1621 aa47.88■■■■■ 5.25
GADD45A-205ENST00000617962 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.78■■■■■ 5.24
GADD45A-205ENST00000617962 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.65■■■■■ 5.22
GADD45A-205ENST00000617962 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.48■■■■■ 5.19
GADD45A-205ENST00000617962 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
GADD45A-205ENST00000617962 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.24■■■■■ 5.15
GADD45A-205ENST00000617962 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.22■■■■■ 5.15
GADD45A-205ENST00000617962 WIZO95785 1651 aa47.07■■■■■ 5.13
GADD45A-205ENST00000617962 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.07■■■■■ 5.13
GADD45A-205ENST00000617962 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.83■■■■■ 5.09
GADD45A-205ENST00000617962 WDR62O43379 1518 aa46.71■■■■■ 5.07
GADD45A-205ENST00000617962 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.61■■■■■ 5.05
GADD45A-205ENST00000617962 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.58■■■■■ 5.05
GADD45A-205ENST00000617962 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.54■■■■■ 5.04
GADD45A-205ENST00000617962 CFTRP13569 1480 aa46.48■■■■■ 5.03
GADD45A-205ENST00000617962 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.03
GADD45A-205ENST00000617962 TRIM41Q8WV44 630 aa46.21■■■■■ 4.99
GADD45A-205ENST00000617962 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
GADD45A-205ENST00000617962 PRDM2Q13029 1718 aa45.99■■■■■ 4.95
GADD45A-205ENST00000617962 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.94■■■■■ 4.95
GADD45A-205ENST00000617962 OSCARQ8IYS5 282 aa45.93■■■■■ 4.94
GADD45A-205ENST00000617962 IFT140Q96RY7 1462 aa45.68■■■■■ 4.9
GADD45A-205ENST00000617962 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.65■■■■■ 4.9
GADD45A-205ENST00000617962 TOPBP1Q92547 1522 aa45.64■■■■■ 4.9
GADD45A-205ENST00000617962 ABCC8Q09428 1581 aa45.5■■■■■ 4.87
GADD45A-205ENST00000617962 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.44■■■■■ 4.86
GADD45A-205ENST00000617962 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.37■■■■■ 4.85
GADD45A-205ENST00000617962 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.37■■■■■ 4.85
GADD45A-205ENST00000617962 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.37■■■■■ 4.85
GADD45A-205ENST00000617962 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.37■■■■■ 4.85
GADD45A-205ENST00000617962 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.24■■■■■ 4.83
GADD45A-205ENST00000617962 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.21■■■■■ 4.832e-8■■■■□ 20.7
GADD45A-205ENST00000617962 ARHGEF11O15085 1522 aa45.2■■■■■ 4.83
GADD45A-205ENST00000617962 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.16■■■■■ 4.82
GADD45A-205ENST00000617962 CHD1O14646 1710 aa45.08■■■■■ 4.81
GADD45A-205ENST00000617962 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.02■■■■■ 4.8
GADD45A-205ENST00000617962 FBLN2P98095 1184 aa44.98■■■■■ 4.79
GADD45A-205ENST00000617962 SOGA1O94964 1423 aa44.95■■■■■ 4.79
GADD45A-205ENST00000617962 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.91■■■■■ 4.78
GADD45A-205ENST00000617962 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.9■■■■■ 4.78
GADD45A-205ENST00000617962 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.85■■■■■ 4.77
GADD45A-205ENST00000617962 CUX1P39880 1505 aa44.78■■■■■ 4.76
GADD45A-205ENST00000617962 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.74■■■■■ 4.75
GADD45A-205ENST00000617962 ARAP1Q96P48 1450 aa44.74■■■■■ 4.75
GADD45A-205ENST00000617962 WDR97A6NE52 1622 aa44.73■■■■■ 4.75
GADD45A-205ENST00000617962 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.59■■■■■ 4.73
GADD45A-205ENST00000617962 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.59■■■■■ 4.73
GADD45A-205ENST00000617962 GRIN2BQ13224 1484 aa44.58■■■■■ 4.73
GADD45A-205ENST00000617962 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.55■■■■■ 4.72
GADD45A-205ENST00000617962 SYNJ1O43426 1573 aa44.51■■■■■ 4.72
GADD45A-205ENST00000617962 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
GADD45A-205ENST00000617962 SYNJ2O15056 1496 aa44.45■■■■■ 4.71
GADD45A-205ENST00000617962 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.41■■■■■ 4.7
GADD45A-205ENST00000617962 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.4■■■■■ 4.7
GADD45A-205ENST00000617962 PBRM1Q86U86 1689 aa44.39■■■■■ 4.7
GADD45A-205ENST00000617962 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.32■■■■■ 4.69
GADD45A-205ENST00000617962 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.27■■■■■ 4.68
GADD45A-205ENST00000617962 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.1■■■■■ 4.65
GADD45A-205ENST00000617962 GRIN2AQ12879 1464 aa44.01■■■■■ 4.64
GADD45A-205ENST00000617962 TOP2BQ02880 1626 aa43.99■■■■■ 4.63
GADD45A-205ENST00000617962 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.99■■■■■ 4.63
GADD45A-205ENST00000617962 ADAMTS12P58397 1594 aa43.96■■■■■ 4.63
GADD45A-205ENST00000617962 CEP170Q5SW79 1584 aa43.87■■■■■ 4.61
GADD45A-205ENST00000617962 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.87■■■■■ 4.61
GADD45A-205ENST00000617962 NUP160Q12769 1436 aa43.86■■■■■ 4.61
GADD45A-205ENST00000617962 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.82■■■■■ 4.61
GADD45A-205ENST00000617962 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.75■■■■■ 4.59
GADD45A-205ENST00000617962 SHROOM2Q13796 1616 aa43.69■■■■■ 4.58
GADD45A-205ENST00000617962 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
GADD45A-205ENST00000617962 JPH4Q96JJ6 628 aa43.43■■■■■ 4.54
GADD45A-205ENST00000617962 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.34■■■■■ 4.53
GADD45A-205ENST00000617962 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.32■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms