Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HGDQ93099 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HGDQ93099 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HGDQ93099 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
HGDQ93099 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HGDQ93099 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HGDQ93099 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HGDQ93099 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HGDQ93099 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HGDQ93099 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
HGDQ93099 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HGDQ93099 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HGDQ93099 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HGDQ93099 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HGDQ93099 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HGDQ93099 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HGDQ93099 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HGDQ93099 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HGDQ93099 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HGDQ93099 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HGDQ93099 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HGDQ93099 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HGDQ93099 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HGDQ93099 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HGDQ93099 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HGDQ93099 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HGDQ93099 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HGDQ93099 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HGDQ93099 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HGDQ93099 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HGDQ93099 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HGDQ93099 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HGDQ93099 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HGDQ93099 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HGDQ93099 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HGDQ93099 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HGDQ93099 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HGDQ93099 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HGDQ93099 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HGDQ93099 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HGDQ93099 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HGDQ93099 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HGDQ93099 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HGDQ93099 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HGDQ93099 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HGDQ93099 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HGDQ93099 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HGDQ93099 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HGDQ93099 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HGDQ93099 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HGDQ93099 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HGDQ93099 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HGDQ93099 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HGDQ93099 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HGDQ93099 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HGDQ93099 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HGDQ93099 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HGDQ93099 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HGDQ93099 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HGDQ93099 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HGDQ93099 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HGDQ93099 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HGDQ93099 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HGDQ93099 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HGDQ93099 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HGDQ93099 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HGDQ93099 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HGDQ93099 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HGDQ93099 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HGDQ93099 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HGDQ93099 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HGDQ93099 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HGDQ93099 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HGDQ93099 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HGDQ93099 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HGDQ93099 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HGDQ93099 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HGDQ93099 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HGDQ93099 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HGDQ93099 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HGDQ93099 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HGDQ93099 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HGDQ93099 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HGDQ93099 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HGDQ93099 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HGDQ93099 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HGDQ93099 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HGDQ93099 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HGDQ93099 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HGDQ93099 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HGDQ93099 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HGDQ93099 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HGDQ93099 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HGDQ93099 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HGDQ93099 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HGDQ93099 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HGDQ93099 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HGDQ93099 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HGDQ93099 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HGDQ93099 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms