Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN4BQ8IWT1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN4BQ8IWT1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN4BQ8IWT1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN4BQ8IWT1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN4BQ8IWT1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN4BQ8IWT1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN4BQ8IWT1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN4BQ8IWT1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN4BQ8IWT1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN4BQ8IWT1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN4BQ8IWT1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms