Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNAB1Q14722 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNAB1Q14722 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNAB1Q14722 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.5 ms