Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KCNAB1Q14722 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KCNAB1Q14722 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KCNAB1Q14722 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KCNAB1Q14722 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
KCNAB1Q14722 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
KCNAB1Q14722 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
KCNAB1Q14722 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KCNAB1Q14722 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KCNAB1Q14722 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KCNAB1Q14722 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KCNAB1Q14722 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KCNAB1Q14722 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KCNAB1Q14722 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KCNAB1Q14722 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KCNAB1Q14722 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KCNAB1Q14722 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KCNAB1Q14722 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
KCNAB1Q14722 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KCNAB1Q14722 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KCNAB1Q14722 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KCNAB1Q14722 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KCNAB1Q14722 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KCNAB1Q14722 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KCNAB1Q14722 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KCNAB1Q14722 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KCNAB1Q14722 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCNAB1Q14722 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCNAB1Q14722 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCNAB1Q14722 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNAB1Q14722 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNAB1Q14722 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNAB1Q14722 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNAB1Q14722 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNAB1Q14722 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNAB1Q14722 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNAB1Q14722 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNAB1Q14722 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNAB1Q14722 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNAB1Q14722 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNAB1Q14722 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNAB1Q14722 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNAB1Q14722 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNAB1Q14722 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNAB1Q14722 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNAB1Q14722 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNAB1Q14722 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNAB1Q14722 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNAB1Q14722 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNAB1Q14722 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNAB1Q14722 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNAB1Q14722 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNAB1Q14722 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNAB1Q14722 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNAB1Q14722 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNAB1Q14722 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNAB1Q14722 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNAB1Q14722 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNAB1Q14722 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNAB1Q14722 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNAB1Q14722 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNAB1Q14722 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNAB1Q14722 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNAB1Q14722 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNAB1Q14722 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNAB1Q14722 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNAB1Q14722 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNAB1Q14722 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNAB1Q14722 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNAB1Q14722 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNAB1Q14722 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNAB1Q14722 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNAB1Q14722 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNAB1Q14722 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNAB1Q14722 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNAB1Q14722 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNAB1Q14722 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNAB1Q14722 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNAB1Q14722 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNAB1Q14722 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNAB1Q14722 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNAB1Q14722 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNAB1Q14722 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNAB1Q14722 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KCNAB1Q14722 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNAB1Q14722 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNAB1Q14722 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNAB1Q14722 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNAB1Q14722 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNAB1Q14722 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNAB1Q14722 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNAB1Q14722 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNAB1Q14722 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNAB1Q14722 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNAB1Q14722 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNAB1Q14722 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNAB1Q14722 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNAB1Q14722 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNAB1Q14722 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNAB1Q14722 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms