Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERV3-1Q14264 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERV3-1Q14264 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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