Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ERV3-1Q14264 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERV3-1Q14264 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ERV3-1Q14264 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERV3-1Q14264 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ERV3-1Q14264 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
ERV3-1Q14264 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ERV3-1Q14264 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERV3-1Q14264 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ERV3-1Q14264 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERV3-1Q14264 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERV3-1Q14264 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERV3-1Q14264 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERV3-1Q14264 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERV3-1Q14264 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ERV3-1Q14264 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERV3-1Q14264 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERV3-1Q14264 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERV3-1Q14264 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERV3-1Q14264 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERV3-1Q14264 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERV3-1Q14264 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERV3-1Q14264 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERV3-1Q14264 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERV3-1Q14264 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERV3-1Q14264 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERV3-1Q14264 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERV3-1Q14264 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERV3-1Q14264 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERV3-1Q14264 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERV3-1Q14264 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERV3-1Q14264 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERV3-1Q14264 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERV3-1Q14264 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERV3-1Q14264 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERV3-1Q14264 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERV3-1Q14264 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERV3-1Q14264 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERV3-1Q14264 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERV3-1Q14264 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERV3-1Q14264 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERV3-1Q14264 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ERV3-1Q14264 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ERV3-1Q14264 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERV3-1Q14264 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ERV3-1Q14264 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERV3-1Q14264 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERV3-1Q14264 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERV3-1Q14264 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERV3-1Q14264 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERV3-1Q14264 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERV3-1Q14264 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERV3-1Q14264 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERV3-1Q14264 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERV3-1Q14264 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERV3-1Q14264 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERV3-1Q14264 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERV3-1Q14264 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERV3-1Q14264 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERV3-1Q14264 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERV3-1Q14264 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERV3-1Q14264 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERV3-1Q14264 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERV3-1Q14264 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ERV3-1Q14264 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERV3-1Q14264 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERV3-1Q14264 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERV3-1Q14264 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERV3-1Q14264 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERV3-1Q14264 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERV3-1Q14264 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERV3-1Q14264 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERV3-1Q14264 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERV3-1Q14264 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERV3-1Q14264 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERV3-1Q14264 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERV3-1Q14264 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERV3-1Q14264 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERV3-1Q14264 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERV3-1Q14264 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERV3-1Q14264 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERV3-1Q14264 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERV3-1Q14264 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERV3-1Q14264 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERV3-1Q14264 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERV3-1Q14264 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERV3-1Q14264 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERV3-1Q14264 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERV3-1Q14264 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERV3-1Q14264 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERV3-1Q14264 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERV3-1Q14264 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERV3-1Q14264 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERV3-1Q14264 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERV3-1Q14264 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERV3-1Q14264 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERV3-1Q14264 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERV3-1Q14264 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERV3-1Q14264 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERV3-1Q14264 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
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