Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PKD2Q13563 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
PKD2Q13563 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PKD2Q13563 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
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