RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.55■■■■■ 6.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.42■■■■■ 5.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCC9O60706 1549 aa51.06■■■■■ 5.76
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.77■■■■■ 5.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.57■■■■■ 5.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NACADO15069 1562 aa48.53■■■■■ 5.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.97■■■■■ 5.27
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.77■■■■■ 5.24
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.65■■■■■ 5.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.65■■■■■ 5.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.53■■■■■ 5.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.47■■■■■ 5.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.28■■■■■ 5.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCRIBQ14160 1630 aa46.94■■■■■ 5.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.68■■■■■ 5.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.11■■■■■ 4.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.11■■■■■ 4.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.93■■■■■ 4.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMARCA4P51532 1647 aa44.8■■■■■ 4.76
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NCAPD3P42695 1498 aa44.79■■■■■ 4.76
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.72■■■■■ 4.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMARCA2P51531 1590 aa44.65■■■■■ 4.74
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HMGXB3Q12766 1538 aa44.48■■■■■ 4.71
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.36■■■■■ 4.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.31■■■■■ 4.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERCC6Q03468 1493 aa44.08■■■■■ 4.65
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NESP48681 1621 aa43.97■■■■■ 4.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WIZO95785 1651 aa43.87■■■■■ 4.61
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CUX2O14529 1486 aa43.76■■■■■ 4.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.72■■■■■ 4.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.61■■■■■ 4.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.49■■■■■ 4.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.49■■■■■ 4.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.41■■■■■ 4.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.27■■■■■ 4.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CFTRP13569 1480 aa43.06■■■■■ 4.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.06■■■■■ 4.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEP164Q9UPV0 1460 aa43■■■■■ 4.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.99■■■■■ 4.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR62O43379 1518 aa42.91■■■■■ 4.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.86■■■■■ 4.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRDM2Q13029 1718 aa42.67■■■■■ 4.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOPBP1Q92547 1522 aa42.21■■■■■ 4.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCC8Q09428 1581 aa42.18■■■■■ 4.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFT140Q96RY7 1462 aa42.11■■■■■ 4.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.1■■■■■ 4.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OSCARQ8IYS5 282 aa41.94■■■■■ 4.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.71■■■■■ 4.27
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SOGA1O94964 1423 aa41.69■■■■■ 4.26
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.67■■■■■ 4.26
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM41Q8WV44 630 aa41.65■■■■■ 4.26
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CUX1P39880 1505 aa41.64■■■■■ 4.26
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.63■■■■■ 4.25
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBLN2P98095 1184 aa41.44■■■■■ 4.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHD1O14646 1710 aa41.41■■■■■ 4.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR97A6NE52 1622 aa41.38■■■■■ 4.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.28■■■■■ 4.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.27■■■■■ 4.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.27■■■■■ 4.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.27■■■■■ 4.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRIN2BQ13224 1484 aa41.24■■■■■ 4.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGEF11O15085 1522 aa41.18■■■■■ 4.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.16■■■■■ 4.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.16■■■■■ 4.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.16■■■■■ 4.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOP2BQ02880 1626 aa41.11■■■■■ 4.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.1■■■■■ 4.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PBRM1Q86U86 1689 aa41.1■■■■■ 4.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYNJ1O43426 1573 aa41.07■■■■■ 4.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.04■■■■■ 4.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYNJ2O15056 1496 aa41.03■■■■■ 4.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.95■■■■■ 4.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.89■■■■■ 4.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARAP1Q96P48 1450 aa40.8■■■■■ 4.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADAMTS12P58397 1594 aa40.71■■■■■ 4.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRIN2AQ12879 1464 aa40.7■■■■■ 4.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.66■■■■■ 4.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.66■■■■■ 4.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEP170Q5SW79 1584 aa40.52■■■■■ 4.08
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUP160Q12769 1436 aa40.51■■■■■ 4.08
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF27Q86VH2 1401 aa40.36■■■■■ 4.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.31■■■■■ 4.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGF1RP08069 1367 aa40.28■■■■■ 4.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SHROOM2Q13796 1616 aa40.27■■■■■ 4.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 JPH4Q96JJ6 628 aa40.19■■■■■ 4.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CUL7Q14999 1698 aa40.17■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms