RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261893.8

LACTB-201, Transcript of lactamase beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LACTB, Length 1,972 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB-201ENST00000261893 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.83■■■■■ 6.53
LACTB-201ENST00000261893 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.24■■■■■ 5.31
LACTB-201ENST00000261893 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
LACTB-201ENST00000261893 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.19■■■■■ 4.98
LACTB-201ENST00000261893 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.15■■■■■ 4.98
LACTB-201ENST00000261893 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.87■■■■■ 4.93
LACTB-201ENST00000261893 ABCC9O60706 1549 aa45.34■■■■■ 4.85
LACTB-201ENST00000261893 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.27■■■■■ 4.84
LACTB-201ENST00000261893 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
LACTB-201ENST00000261893 NACADO15069 1562 aa44.74■■■■■ 4.75
LACTB-201ENST00000261893 SCRIBQ14160 1630 aa44.52■■■■■ 4.72
LACTB-201ENST00000261893 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.14■■■■■ 4.66
LACTB-201ENST00000261893 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
LACTB-201ENST00000261893 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.44■■■■■ 4.54
LACTB-201ENST00000261893 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.33■■■■■ 4.53
LACTB-201ENST00000261893 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.3■■■■■ 4.52
LACTB-201ENST00000261893 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.17■■■■■ 4.5
LACTB-201ENST00000261893 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
LACTB-201ENST00000261893 WIZO95785 1651 aa42.88■■■■■ 4.45
LACTB-201ENST00000261893 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.81■■■■■ 4.44
LACTB-201ENST00000261893 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.77■■■■■ 4.44
LACTB-201ENST00000261893 SMARCA4P51532 1647 aa42.73■■■■■ 4.43
LACTB-201ENST00000261893 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
LACTB-201ENST00000261893 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.16■■■■■ 4.34
LACTB-201ENST00000261893 TRIM41Q8WV44 630 aa42.15■■■■■ 4.34
LACTB-201ENST00000261893 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
LACTB-201ENST00000261893 SMARCA2P51531 1590 aa42.07■■■■■ 4.33
LACTB-201ENST00000261893 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.04■■■■■ 4.32
LACTB-201ENST00000261893 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.82■■■■■ 4.29
LACTB-201ENST00000261893 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.81■■■■■ 4.28
LACTB-201ENST00000261893 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
LACTB-201ENST00000261893 ABCC8Q09428 1581 aa41.43■■■■■ 4.22
LACTB-201ENST00000261893 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
LACTB-201ENST00000261893 HMGXB3Q12766 1538 aa41.31■■■■■ 4.2
LACTB-201ENST00000261893 NCAPD3P42695 1498 aa41.3■■■■■ 4.2
LACTB-201ENST00000261893 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.07■■■■■ 4.16
LACTB-201ENST00000261893 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.99■■■■■ 4.15
LACTB-201ENST00000261893 EEA1Q15075 1411 aa40.96■■■■■ 4.15
LACTB-201ENST00000261893 SYNJ1O43426 1573 aa40.86■■■■■ 4.13
LACTB-201ENST00000261893 SOGA1O94964 1423 aa40.85■■■■■ 4.13
LACTB-201ENST00000261893 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.85■■■■■ 4.13
LACTB-201ENST00000261893 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.79■■■■■ 4.12
LACTB-201ENST00000261893 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.66■■■■■ 4.1
LACTB-201ENST00000261893 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.64■■■■■ 4.1
LACTB-201ENST00000261893 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
LACTB-201ENST00000261893 CFTRP13569 1480 aa40.63■■■■■ 4.09
LACTB-201ENST00000261893 TOP2BQ02880 1626 aa40.62■■■■■ 4.09
LACTB-201ENST00000261893 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.56■■■■■ 4.08
LACTB-201ENST00000261893 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.48■■■■■ 4.07
LACTB-201ENST00000261893 PRDM2Q13029 1718 aa40.46■■■■■ 4.07
LACTB-201ENST00000261893 GOLGA3Q08378 1498 aa40.42■■■■■ 4.06
LACTB-201ENST00000261893 HRCP23327 699 aa40.4■■■■■ 4.06
LACTB-201ENST00000261893 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.37■■■■■ 4.05
LACTB-201ENST00000261893 KIF21BO75037 1637 aa40.36■■■■■ 4.05
LACTB-201ENST00000261893 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.33■■■■■ 4.05
LACTB-201ENST00000261893 CEP162Q5TB80 1403 aa40.32■■■■■ 4.04
LACTB-201ENST00000261893 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.32■■■■■ 4.04
LACTB-201ENST00000261893 CUX1P39880 1505 aa40.31■■■■■ 4.04
LACTB-201ENST00000261893 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
LACTB-201ENST00000261893 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.98■■■■□ 3.99
LACTB-201ENST00000261893 KIF27Q86VH2 1401 aa39.96■■■■□ 3.99
LACTB-201ENST00000261893 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.94■■■■□ 3.98
LACTB-201ENST00000261893 PRXQ9BXM0 1461 aa39.91■■■■□ 3.98
LACTB-201ENST00000261893 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.87■■■■□ 3.97
LACTB-201ENST00000261893 CLIP1P30622 1438 aa39.82■■■■□ 3.96
LACTB-201ENST00000261893 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
LACTB-201ENST00000261893 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.74■■■■□ 3.95
LACTB-201ENST00000261893 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.73■■■■□ 3.95
LACTB-201ENST00000261893 NESP48681 1621 aa39.73■■■■□ 3.95
LACTB-201ENST00000261893 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.67■■■■□ 3.94
LACTB-201ENST00000261893 CUX2O14529 1486 aa39.65■■■■□ 3.94
LACTB-201ENST00000261893 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.59■■■■□ 3.93
LACTB-201ENST00000261893 TOPBP1Q92547 1522 aa39.54■■■■□ 3.92
LACTB-201ENST00000261893 IGF1RP08069 1367 aa39.51■■■■□ 3.92
LACTB-201ENST00000261893 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
LACTB-201ENST00000261893 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.42■■■■□ 3.9
LACTB-201ENST00000261893 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
LACTB-201ENST00000261893 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.41■■■■□ 3.9
LACTB-201ENST00000261893 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.34■■■■□ 3.89
LACTB-201ENST00000261893 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.89
LACTB-201ENST00000261893 ARAP1Q96P48 1450 aa39.31■■■■□ 3.88
LACTB-201ENST00000261893 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.3■■■■□ 3.88
LACTB-201ENST00000261893 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
LACTB-201ENST00000261893 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
LACTB-201ENST00000261893 APLP2Q06481 763 aa39.24■■■■□ 3.87
LACTB-201ENST00000261893 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.18■■■■□ 3.86
LACTB-201ENST00000261893 WDR97A6NE52 1622 aa39.17■■■■□ 3.86
LACTB-201ENST00000261893 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.14■■■■□ 3.86
LACTB-201ENST00000261893 CUL7Q14999 1698 aa39.12■■■■□ 3.85
LACTB-201ENST00000261893 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39■■■■□ 3.83
LACTB-201ENST00000261893 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
LACTB-201ENST00000261893 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.88■■■■□ 3.82
LACTB-201ENST00000261893 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
LACTB-201ENST00000261893 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
LACTB-201ENST00000261893 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.86■■■■□ 3.81
LACTB-201ENST00000261893 ERCC6Q03468 1493 aa38.84■■■■□ 3.81
LACTB-201ENST00000261893 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.84■■■■□ 3.81
LACTB-201ENST00000261893 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.81■■■■□ 3.8
LACTB-201ENST00000261893 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.75■■■■□ 3.79
LACTB-201ENST00000261893 MAP3K1Q13233 1512 aa38.75■■■■□ 3.79
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