Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ELP6Q0PNE2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELP6Q0PNE2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP6Q0PNE2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP6Q0PNE2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP6Q0PNE2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP6Q0PNE2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP6Q0PNE2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP6Q0PNE2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP6Q0PNE2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP6Q0PNE2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP6Q0PNE2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP6Q0PNE2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms