Protein–RNA interactions for Protein: P49763

PGF, Placenta growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGFP49763 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGFP49763 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGFP49763 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGFP49763 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGFP49763 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGFP49763 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGFP49763 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGFP49763 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGFP49763 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGFP49763 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGFP49763 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGFP49763 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGFP49763 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGFP49763 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGFP49763 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGFP49763 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGFP49763 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGFP49763 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGFP49763 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGFP49763 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGFP49763 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGFP49763 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGFP49763 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGFP49763 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGFP49763 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGFP49763 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGFP49763 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGFP49763 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGFP49763 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGFP49763 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGFP49763 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGFP49763 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGFP49763 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGFP49763 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PGFP49763 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGFP49763 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGFP49763 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGFP49763 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGFP49763 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGFP49763 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGFP49763 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGFP49763 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGFP49763 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGFP49763 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGFP49763 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGFP49763 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGFP49763 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PGFP49763 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGFP49763 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGFP49763 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PGFP49763 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGFP49763 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGFP49763 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGFP49763 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGFP49763 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGFP49763 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGFP49763 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGFP49763 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGFP49763 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGFP49763 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGFP49763 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGFP49763 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGFP49763 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGFP49763 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGFP49763 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGFP49763 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGFP49763 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PGFP49763 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PGFP49763 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGFP49763 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGFP49763 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGFP49763 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGFP49763 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGFP49763 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGFP49763 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGFP49763 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGFP49763 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGFP49763 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGFP49763 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGFP49763 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGFP49763 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGFP49763 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGFP49763 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PGFP49763 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGFP49763 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGFP49763 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGFP49763 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGFP49763 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGFP49763 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGFP49763 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGFP49763 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGFP49763 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGFP49763 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGFP49763 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGFP49763 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGFP49763 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PGFP49763 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGFP49763 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGFP49763 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGFP49763 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms