Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4BP23588 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
EIF4BP23588 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms