Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAMP3O14828 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAMP3O14828 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms