Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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HOXA5P20719 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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HOXA5P20719 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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HOXA5P20719 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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HOXA5P20719 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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HOXA5P20719 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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HOXA5P20719 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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HOXA5P20719 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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HOXA5P20719 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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HOXA5P20719 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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HOXA5P20719 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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