Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA5P20719 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA5P20719 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA5P20719 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA5P20719 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA5P20719 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA5P20719 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA5P20719 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA5P20719 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA5P20719 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA5P20719 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA5P20719 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA5P20719 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA5P20719 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA5P20719 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA5P20719 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA5P20719 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA5P20719 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA5P20719 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA5P20719 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA5P20719 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA5P20719 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA5P20719 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA5P20719 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA5P20719 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA5P20719 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA5P20719 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA5P20719 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA5P20719 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA5P20719 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA5P20719 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA5P20719 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA5P20719 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA5P20719 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA5P20719 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA5P20719 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA5P20719 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA5P20719 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA5P20719 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA5P20719 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA5P20719 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA5P20719 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA5P20719 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXA5P20719 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA5P20719 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA5P20719 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA5P20719 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA5P20719 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA5P20719 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA5P20719 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA5P20719 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA5P20719 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA5P20719 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA5P20719 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA5P20719 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA5P20719 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA5P20719 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA5P20719 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA5P20719 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA5P20719 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA5P20719 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA5P20719 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA5P20719 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA5P20719 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA5P20719 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA5P20719 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA5P20719 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA5P20719 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA5P20719 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA5P20719 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA5P20719 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA5P20719 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXA5P20719 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA5P20719 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA5P20719 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA5P20719 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA5P20719 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA5P20719 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA5P20719 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA5P20719 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA5P20719 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA5P20719 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA5P20719 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA5P20719 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA5P20719 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA5P20719 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA5P20719 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA5P20719 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA5P20719 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA5P20719 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA5P20719 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA5P20719 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA5P20719 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA5P20719 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA5P20719 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA5P20719 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXA5P20719 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA5P20719 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA5P20719 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA5P20719 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms