Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PDE3BQ13370 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDE3BQ13370 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
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