RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532407.5

TMEM218-215, Transcript of transmembrane protein 218, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM218, Length 1,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM218-215ENST00000532407 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.46■■■■■ 6.79
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TMEM218-215ENST00000532407 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.23■■■■■ 5.47
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TMEM218-215ENST00000532407 WDR62O43379 1518 aa43.35■■■■■ 4.53
TMEM218-215ENST00000532407 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
TMEM218-215ENST00000532407 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.34■■■■■ 4.53
TMEM218-215ENST00000532407 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.28■■■■■ 4.52
TMEM218-215ENST00000532407 CFTRP13569 1480 aa43.23■■■■■ 4.51
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TMEM218-215ENST00000532407 TOPBP1Q92547 1522 aa42.41■■■■■ 4.38
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TMEM218-215ENST00000532407 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.07■■■■■ 4.335e-7■■■■□ 22.1
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TMEM218-215ENST00000532407 NUP160Q12769 1436 aa40.77■■■■■ 4.12
TMEM218-215ENST00000532407 CEP170Q5SW79 1584 aa40.7■■■■■ 4.11
TMEM218-215ENST00000532407 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.68■■■■■ 4.1
TMEM218-215ENST00000532407 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.67■■■■■ 4.1
TMEM218-215ENST00000532407 JPH4Q96JJ6 628 aa40.51■■■■■ 4.08
TMEM218-215ENST00000532407 SHROOM2Q13796 1616 aa40.49■■■■■ 4.07
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TMEM218-215ENST00000532407 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.25■■■■■ 4.03
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