Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC46.04■■■■■ 4.96
PDE3BQ13370 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.93■■■■■ 4.94
PDE3BQ13370 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
PDE3BQ13370 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
PDE3BQ13370 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
PDE3BQ13370 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
PDE3BQ13370 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
PDE3BQ13370 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
PDE3BQ13370 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
PDE3BQ13370 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC43.93■■■■■ 4.62
PDE3BQ13370 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
PDE3BQ13370 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
PDE3BQ13370 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
PDE3BQ13370 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
PDE3BQ13370 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
PDE3BQ13370 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
PDE3BQ13370 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
PDE3BQ13370 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
PDE3BQ13370 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
PDE3BQ13370 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
PDE3BQ13370 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
PDE3BQ13370 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
PDE3BQ13370 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
PDE3BQ13370 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
PDE3BQ13370 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
PDE3BQ13370 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
PDE3BQ13370 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
PDE3BQ13370 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
PDE3BQ13370 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PDE3BQ13370 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PDE3BQ13370 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
PDE3BQ13370 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
PDE3BQ13370 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
PDE3BQ13370 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
PDE3BQ13370 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
PDE3BQ13370 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
PDE3BQ13370 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
PDE3BQ13370 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
PDE3BQ13370 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
PDE3BQ13370 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PDE3BQ13370 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
PDE3BQ13370 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
PDE3BQ13370 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
PDE3BQ13370 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
PDE3BQ13370 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
PDE3BQ13370 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PDE3BQ13370 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
PDE3BQ13370 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
PDE3BQ13370 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PDE3BQ13370 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
PDE3BQ13370 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
PDE3BQ13370 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PDE3BQ13370 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
PDE3BQ13370 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PDE3BQ13370 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
PDE3BQ13370 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
PDE3BQ13370 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
PDE3BQ13370 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PDE3BQ13370 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PDE3BQ13370 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PDE3BQ13370 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PDE3BQ13370 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PDE3BQ13370 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PDE3BQ13370 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
PDE3BQ13370 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
PDE3BQ13370 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
PDE3BQ13370 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PDE3BQ13370 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PDE3BQ13370 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PDE3BQ13370 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
PDE3BQ13370 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PDE3BQ13370 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PDE3BQ13370 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PDE3BQ13370 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PDE3BQ13370 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
PDE3BQ13370 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
PDE3BQ13370 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
PDE3BQ13370 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PDE3BQ13370 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
PDE3BQ13370 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PDE3BQ13370 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
PDE3BQ13370 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PDE3BQ13370 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PDE3BQ13370 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PDE3BQ13370 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PDE3BQ13370 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
PDE3BQ13370 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PDE3BQ13370 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PDE3BQ13370 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PDE3BQ13370 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PDE3BQ13370 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PDE3BQ13370 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PDE3BQ13370 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
PDE3BQ13370 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PDE3BQ13370 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
PDE3BQ13370 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PDE3BQ13370 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PDE3BQ13370 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PDE3BQ13370 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PDE3BQ13370 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
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