Protein–RNA interactions for Protein: P43243

MATR3, Matrin-3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATR3P43243 BRAF-202ENST00000469930 1058 ntTSL 222.66■■□□□ 1.224e-7■■■■■ 30.2
MATR3P43243 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.954e-7■■■■■ 30.2
MATR3P43243 BRAF-205ENST00000497784 2336 ntTSL 58.76□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 30.2
MATR3P43243 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.632e-6■■■■■ 30.2
MATR3P43243 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.452e-6■■■■■ 30.2
MATR3P43243 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 516.92■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 30.2
MATR3P43243 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 30.2
MATR3P43243 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 413.33□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 30.2
MATR3P43243 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.274e-8■■■■■ 30.2
MATR3P43243 PANK2-202ENST00000336066 1843 ntTSL 1 (best)27.09■■□□□ 1.934e-8■■■■■ 30.2
MATR3P43243 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.614e-8■■■■■ 30.2
MATR3P43243 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.494e-8■■■■■ 30.2
MATR3P43243 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 30.2
MATR3P43243 USP47-205ENST00000525257 548 ntTSL 426.12■■□□□ 1.771e-6■■■■■ 30.2
MATR3P43243 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 30.2
MATR3P43243 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 30.2
MATR3P43243 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 30.2
MATR3P43243 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 SMARCA4-219ENST00000592604 2940 ntTSL 1 (best)16.45■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 SMARCA4-206ENST00000538456 738 ntTSL 315.26■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 SMARCA4-208ENST00000585799 3842 ntTSL 213.88□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 SMARCA4-217ENST00000591595 3377 ntTSL 213.21□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 SMARCA4-218ENST00000592158 409 ntTSL 29.18□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 MYO18A-213ENST00000532143 1002 ntTSL 317.76■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 30.1
MATR3P43243 MYO18A-207ENST00000530254 6479 ntTSL 1 (best)15.51■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 30.1
MATR3P43243 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 30.1
MATR3P43243 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 30.1
MATR3P43243 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 30.1
MATR3P43243 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 30.1
MATR3P43243 PARD3-211ENST00000466092 806 ntTSL 57.98□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 GYPC-205ENST00000464053 1805 ntTSL 1 (best)16.82■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 GYPC-204ENST00000459787 758 ntTSL 315.66■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 30.1
MATR3P43243 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.538e-7■■■■■ 30
MATR3P43243 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.888e-7■■■■■ 30
MATR3P43243 TMEM245-202ENST00000413712 1973 ntTSL 28.56□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 30
MATR3P43243 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 30
MATR3P43243 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 30
MATR3P43243 HBS1L-213ENST00000529169 633 ntTSL 37.25□□□□□ -1.257e-8■■■■■ 30
MATR3P43243 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 30
MATR3P43243 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 30
MATR3P43243 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.485e-8■■■■■ 30
MATR3P43243 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.295e-8■■■■■ 30
MATR3P43243 RAD23B-205ENST00000457811 811 ntTSL 35.11□□□□□ -1.591e-8■■■■■ 30
MATR3P43243 PIAS1-206ENST00000564915 671 ntTSL 54.66□□□□□ -1.666e-9■■■■■ 29.9
MATR3P43243 PIAS1-203ENST00000562190 766 ntTSL 33.61□□□□□ -1.836e-9■■■■■ 29.9
MATR3P43243 SRPK1-210ENST00000508473 858 ntTSL 226.43■■□□□ 1.828e-7■■■■■ 29.9
MATR3P43243 SRPK1-209ENST00000507909 581 ntTSL 410.69□□□□□ -0.78e-7■■■■■ 29.9
MATR3P43243 SRPK1-212ENST00000512445 559 ntTSL 57.27□□□□□ -1.258e-7■■■■■ 29.9
MATR3P43243 SRPK1-213ENST00000513367 634 ntTSL 26.49□□□□□ -1.378e-7■■■■■ 29.9
MATR3P43243 RREB1-208ENST00000483150 2833 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 29.9
MATR3P43243 WDR4-206ENST00000479429 759 ntTSL 524.29■■□□□ 1.486e-8■■■■■ 29.9
MATR3P43243 WDR4-203ENST00000463902 609 ntTSL 314.74□□□□□ -0.056e-8■■■■■ 29.9
MATR3P43243 MECP2-210ENST00000488293 1198 ntTSL 514.55□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 29.9
MATR3P43243 MECP2-206ENST00000460227 1298 ntTSL 514.01□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 29.9
MATR3P43243 MECP2-207ENST00000463644 1088 ntTSL 312.65□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 29.9
MATR3P43243 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.116e-7■■■■■ 29.9
MATR3P43243 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.926e-7■■■■■ 29.9
MATR3P43243 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 29.9
MATR3P43243 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 29.9
MATR3P43243 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.36e-7■■■■■ 29.9
MATR3P43243 AGFG1-207ENST00000458212 815 ntTSL 24.02□□□□□ -1.776e-7■■■■■ 29.9
MATR3P43243 AKT2-239ENST00000583859 567 ntTSL 527.94■■■□□ 2.063e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 AKT2-203ENST00000391844 1795 ntTSL 1 (best)26.73■■□□□ 1.873e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 CYTH1-216ENST00000591574 1043 ntTSL 326.6■■□□□ 1.851e-6■■■■■ 29.8
MATR3P43243 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.53e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.493e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.393e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.383e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 AKT2-214ENST00000456441 582 ntTSL 323.36■■□□□ 1.333e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 ESYT2-202ENST00000275418 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 523.06■■□□□ 1.283e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 HIVEP1-203ENST00000442081 1044 ntTSL 321.78■■□□□ 1.083e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 AKT2-240ENST00000584288 1706 ntTSL 221.26■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 29.8
MATR3P43243 AKT2-228ENST00000537834 1402 ntTSL 219.92■□□□□ 0.783e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.753e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 HIVEP1-204ENST00000478545 576 ntTSL 417.76■□□□□ 0.433e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 AKT2-221ENST00000487537 954 ntTSL 217.65■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 NEPRO-218ENST00000489848 1576 ntTSL 217.42■□□□□ 0.383e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 AKT2-212ENST00000441941 974 ntTSL 417.14■□□□□ 0.333e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 NEPRO-209ENST00000470663 545 ntTSL 416.94■□□□□ 0.33e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 29.8
MATR3P43243 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.263e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.243e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 NEPRO-220ENST00000494164 741 ntTSL 416.42■□□□□ 0.223e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 NEPRO-203ENST00000460410 947 ntTSL 316.42■□□□□ 0.223e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 29.8
MATR3P43243 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 29.8
MATR3P43243 AKT2-205ENST00000392037 681 ntTSL 215.74■□□□□ 0.113e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.13e-8■■■■■ 29.8
MATR3P43243 NEPRO-211ENST00000472637 2179 ntTSL 1 (best)15.63■□□□□ 0.093e-8■■■■■ 29.8
Retrieved 100 of 16,209 protein–RNA pairs in 358.8 ms