RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525257.1

USP47-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 47, humanhuman

TSL 4

Gene USP47, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47-205ENST00000525257 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.41■■■■■ 7.26
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USP47-205ENST00000525257 SCRIBQ14160 1630 aa49.52■■■■■ 5.52
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USP47-205ENST00000525257 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.53■■■■■ 4.56
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USP47-205ENST00000525257 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.75■■■■■ 4.43
USP47-205ENST00000525257 SHROOM2Q13796 1616 aa42.7■■■■■ 4.43
USP47-205ENST00000525257 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
USP47-205ENST00000525257 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.38■■■■■ 4.37
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USP47-205ENST00000525257 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
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