Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHBP21912 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHBP21912 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHBP21912 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHBP21912 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHBP21912 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHBP21912 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHBP21912 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHBP21912 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHBP21912 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHBP21912 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHBP21912 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHBP21912 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHBP21912 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHBP21912 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHBP21912 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHBP21912 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHBP21912 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHBP21912 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHBP21912 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDHBP21912 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SDHBP21912 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDHBP21912 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDHBP21912 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDHBP21912 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDHBP21912 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SDHBP21912 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDHBP21912 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDHBP21912 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHBP21912 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHBP21912 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHBP21912 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHBP21912 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHBP21912 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHBP21912 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHBP21912 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHBP21912 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHBP21912 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHBP21912 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHBP21912 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDHBP21912 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDHBP21912 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SDHBP21912 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDHBP21912 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDHBP21912 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDHBP21912 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDHBP21912 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDHBP21912 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDHBP21912 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDHBP21912 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SDHBP21912 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SDHBP21912 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDHBP21912 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDHBP21912 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDHBP21912 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDHBP21912 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SDHBP21912 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHBP21912 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHBP21912 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHBP21912 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHBP21912 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHBP21912 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHBP21912 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHBP21912 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHBP21912 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHBP21912 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDHBP21912 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDHBP21912 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SDHBP21912 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDHBP21912 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDHBP21912 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDHBP21912 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDHBP21912 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHBP21912 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHBP21912 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHBP21912 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHBP21912 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHBP21912 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHBP21912 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHBP21912 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHBP21912 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHBP21912 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHBP21912 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHBP21912 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHBP21912 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHBP21912 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHBP21912 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHBP21912 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHBP21912 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHBP21912 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHBP21912 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHBP21912 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHBP21912 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHBP21912 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHBP21912 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHBP21912 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHBP21912 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHBP21912 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDHBP21912 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDHBP21912 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms