RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617652.1

AC110285.6-201, humanhuman

BASIC

Gene AC110285.6, Length 491 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC110285.6-201ENST00000617652 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.47■■■■■ 6.63
AC110285.6-201ENST00000617652 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.69■■■■■ 5.7
AC110285.6-201ENST00000617652 ABCC9O60706 1549 aa50.57■■■■■ 5.69
AC110285.6-201ENST00000617652 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.17■■■■■ 5.3
AC110285.6-201ENST00000617652 NACADO15069 1562 aa47.85■■■■■ 5.25
AC110285.6-201ENST00000617652 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.51■■■■■ 5.2
AC110285.6-201ENST00000617652 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.41■■■■■ 5.18
AC110285.6-201ENST00000617652 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.22■■■■■ 5.15
AC110285.6-201ENST00000617652 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.22■■■■■ 5.15
AC110285.6-201ENST00000617652 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.06■■■■■ 5.12
AC110285.6-201ENST00000617652 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.84■■■■■ 5.09
AC110285.6-201ENST00000617652 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.83■■■■■ 5.09
AC110285.6-201ENST00000617652 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.64■■■■■ 5.06
AC110285.6-201ENST00000617652 SCRIBQ14160 1630 aa46.17■■■■■ 4.98
AC110285.6-201ENST00000617652 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.13■■■■■ 4.98
AC110285.6-201ENST00000617652 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.73■■■■■ 4.91
AC110285.6-201ENST00000617652 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.64■■■■■ 4.9
AC110285.6-201ENST00000617652 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.54■■■■■ 4.88
AC110285.6-201ENST00000617652 NCAPD3P42695 1498 aa44.17■■■■■ 4.66
AC110285.6-201ENST00000617652 SMARCA4P51532 1647 aa44.06■■■■■ 4.64
AC110285.6-201ENST00000617652 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.06■■■■■ 4.64
AC110285.6-201ENST00000617652 SMARCA2P51531 1590 aa43.92■■■■■ 4.62
AC110285.6-201ENST00000617652 HMGXB3Q12766 1538 aa43.88■■■■■ 4.61
AC110285.6-201ENST00000617652 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.82■■■■■ 4.61
AC110285.6-201ENST00000617652 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.64■■■■■ 4.58
AC110285.6-201ENST00000617652 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
AC110285.6-201ENST00000617652 ERCC6Q03468 1493 aa43.61■■■■■ 4.57
AC110285.6-201ENST00000617652 CUX2O14529 1486 aa43.55■■■■■ 4.56
AC110285.6-201ENST00000617652 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.54■■■■■ 4.56
AC110285.6-201ENST00000617652 NESP48681 1621 aa43.5■■■■■ 4.55
AC110285.6-201ENST00000617652 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.43■■■■■ 4.54
AC110285.6-201ENST00000617652 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.18■■■■■ 4.5
AC110285.6-201ENST00000617652 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
AC110285.6-201ENST00000617652 WIZO95785 1651 aa43.04■■■■■ 4.48
AC110285.6-201ENST00000617652 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.98■■■■■ 4.47
AC110285.6-201ENST00000617652 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.87■■■■■ 4.45
AC110285.6-201ENST00000617652 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.81■■■■■ 4.44
AC110285.6-201ENST00000617652 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.41
AC110285.6-201ENST00000617652 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.55■■■■■ 4.4
AC110285.6-201ENST00000617652 WDR62O43379 1518 aa42.47■■■■■ 4.39
AC110285.6-201ENST00000617652 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
AC110285.6-201ENST00000617652 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.38■■■■■ 4.38
AC110285.6-201ENST00000617652 CFTRP13569 1480 aa42.36■■■■■ 4.37
AC110285.6-201ENST00000617652 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.35■■■■■ 4.37
AC110285.6-201ENST00000617652 PRDM2Q13029 1718 aa42.05■■■■■ 4.32
AC110285.6-201ENST00000617652 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
AC110285.6-201ENST00000617652 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.97■■■■■ 4.31
AC110285.6-201ENST00000617652 TOPBP1Q92547 1522 aa41.58■■■■■ 4.25
AC110285.6-201ENST00000617652 TRIM41Q8WV44 630 aa41.52■■■■■ 4.24
AC110285.6-201ENST00000617652 IFT140Q96RY7 1462 aa41.52■■■■■ 4.24
AC110285.6-201ENST00000617652 OSCARQ8IYS5 282 aa41.5■■■■■ 4.23
AC110285.6-201ENST00000617652 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
AC110285.6-201ENST00000617652 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.43■■■■■ 4.22
AC110285.6-201ENST00000617652 ABCC8Q09428 1581 aa41.42■■■■■ 4.22
AC110285.6-201ENST00000617652 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
AC110285.6-201ENST00000617652 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
AC110285.6-201ENST00000617652 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
AC110285.6-201ENST00000617652 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.1■■■■■ 4.17
AC110285.6-201ENST00000617652 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.07■■■■■ 4.17
AC110285.6-201ENST00000617652 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.07■■■■■ 4.17
AC110285.6-201ENST00000617652 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.07■■■■■ 4.17
AC110285.6-201ENST00000617652 CHD1O14646 1710 aa41.01■■■■■ 4.16
AC110285.6-201ENST00000617652 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41■■■■■ 4.15
AC110285.6-201ENST00000617652 ARHGEF11O15085 1522 aa40.93■■■■■ 4.14
AC110285.6-201ENST00000617652 SOGA1O94964 1423 aa40.92■■■■■ 4.14
AC110285.6-201ENST00000617652 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.9■■■■■ 4.14
AC110285.6-201ENST00000617652 CUX1P39880 1505 aa40.9■■■■■ 4.14
AC110285.6-201ENST00000617652 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
AC110285.6-201ENST00000617652 WDR97A6NE52 1622 aa40.78■■■■■ 4.12
AC110285.6-201ENST00000617652 FBLN2P98095 1184 aa40.74■■■■■ 4.11
AC110285.6-201ENST00000617652 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
AC110285.6-201ENST00000617652 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.69■■■■■ 4.1
AC110285.6-201ENST00000617652 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
AC110285.6-201ENST00000617652 GRIN2BQ13224 1484 aa40.57■■■■■ 4.08
AC110285.6-201ENST00000617652 ARAP1Q96P48 1450 aa40.55■■■■■ 4.08
AC110285.6-201ENST00000617652 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.54■■■■■ 4.08
AC110285.6-201ENST00000617652 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.51■■■■■ 4.08
AC110285.6-201ENST00000617652 PBRM1Q86U86 1689 aa40.5■■■■■ 4.07
AC110285.6-201ENST00000617652 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
AC110285.6-201ENST00000617652 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.45■■■■■ 4.07
AC110285.6-201ENST00000617652 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.44■■■■■ 4.06
AC110285.6-201ENST00000617652 SYNJ2O15056 1496 aa40.44■■■■■ 4.06
AC110285.6-201ENST00000617652 SYNJ1O43426 1573 aa40.44■■■■■ 4.06
AC110285.6-201ENST00000617652 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.42■■■■■ 4.06
AC110285.6-201ENST00000617652 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.28■■■■■ 4.04
AC110285.6-201ENST00000617652 TOP2BQ02880 1626 aa40.26■■■■■ 4.04
AC110285.6-201ENST00000617652 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.24■■■■■ 4.03
AC110285.6-201ENST00000617652 ADAMTS12P58397 1594 aa40.1■■■■■ 4.01
AC110285.6-201ENST00000617652 GRIN2AQ12879 1464 aa40.07■■■■■ 4.01
AC110285.6-201ENST00000617652 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
AC110285.6-201ENST00000617652 CEP170Q5SW79 1584 aa39.97■■■■□ 3.99
AC110285.6-201ENST00000617652 NUP160Q12769 1436 aa39.94■■■■□ 3.98
AC110285.6-201ENST00000617652 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.92■■■■□ 3.98
AC110285.6-201ENST00000617652 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.91■■■■□ 3.98
AC110285.6-201ENST00000617652 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.9■■■■□ 3.98
AC110285.6-201ENST00000617652 SHROOM2Q13796 1616 aa39.81■■■■□ 3.96
AC110285.6-201ENST00000617652 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.54■■■■□ 3.92
AC110285.6-201ENST00000617652 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
AC110285.6-201ENST00000617652 JPH4Q96JJ6 628 aa39.47■■■■□ 3.91
AC110285.6-201ENST00000617652 IGF1RP08069 1367 aa39.41■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.1 ms