RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498124.1

CDKN2A-208, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDKN2A, Length 880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-208ENST00000498124 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.58■■■■■ 6.65
CDKN2A-208ENST00000498124 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.72■■■■■ 5.71
CDKN2A-208ENST00000498124 ABCC9O60706 1549 aa50.46■■■■■ 5.67
CDKN2A-208ENST00000498124 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.12■■■■■ 5.29
CDKN2A-208ENST00000498124 NACADO15069 1562 aa47.85■■■■■ 5.25
CDKN2A-208ENST00000498124 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.44■■■■■ 5.18
CDKN2A-208ENST00000498124 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.3■■■■■ 5.16
CDKN2A-208ENST00000498124 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.17■■■■■ 5.14
CDKN2A-208ENST00000498124 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.12■■■■■ 5.13
CDKN2A-208ENST00000498124 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
CDKN2A-208ENST00000498124 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.95■■■■■ 5.11
CDKN2A-208ENST00000498124 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.81■■■■■ 5.08
CDKN2A-208ENST00000498124 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.78■■■■■ 5.08
CDKN2A-208ENST00000498124 SCRIBQ14160 1630 aa46.2■■■■■ 4.99
CDKN2A-208ENST00000498124 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.15■■■■■ 4.98
CDKN2A-208ENST00000498124 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.63■■■■■ 4.89
CDKN2A-208ENST00000498124 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
CDKN2A-208ENST00000498124 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.42■■■■■ 4.86
CDKN2A-208ENST00000498124 NCAPD3P42695 1498 aa44.18■■■■■ 4.66
CDKN2A-208ENST00000498124 SMARCA4P51532 1647 aa44.12■■■■■ 4.65
CDKN2A-208ENST00000498124 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.08■■■■■ 4.65
CDKN2A-208ENST00000498124 SMARCA2P51531 1590 aa43.95■■■■■ 4.63
CDKN2A-208ENST00000498124 HMGXB3Q12766 1538 aa43.9■■■■■ 4.62
CDKN2A-208ENST00000498124 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.62
CDKN2A-208ENST00000498124 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.71■■■■■ 4.59
CDKN2A-208ENST00000498124 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
CDKN2A-208ENST00000498124 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.62■■■■■ 4.57
CDKN2A-208ENST00000498124 ERCC6Q03468 1493 aa43.49■■■■■ 4.55
CDKN2A-208ENST00000498124 NESP48681 1621 aa43.44■■■■■ 4.55
CDKN2A-208ENST00000498124 CUX2O14529 1486 aa43.41■■■■■ 4.54
CDKN2A-208ENST00000498124 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.15■■■■■ 4.5
CDKN2A-208ENST00000498124 WIZO95785 1651 aa43.1■■■■■ 4.49
CDKN2A-208ENST00000498124 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.09■■■■■ 4.49
CDKN2A-208ENST00000498124 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
CDKN2A-208ENST00000498124 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.91■■■■■ 4.46
CDKN2A-208ENST00000498124 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.82■■■■■ 4.45
CDKN2A-208ENST00000498124 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.81■■■■■ 4.44
CDKN2A-208ENST00000498124 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.77■■■■■ 4.44
CDKN2A-208ENST00000498124 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
CDKN2A-208ENST00000498124 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.51■■■■■ 4.4
CDKN2A-208ENST00000498124 WDR62O43379 1518 aa42.45■■■■■ 4.39
CDKN2A-208ENST00000498124 CFTRP13569 1480 aa42.42■■■■■ 4.38
CDKN2A-208ENST00000498124 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.36■■■■■ 4.37
CDKN2A-208ENST00000498124 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.34■■■■■ 4.37
CDKN2A-208ENST00000498124 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.05■■■■■ 4.32
CDKN2A-208ENST00000498124 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
CDKN2A-208ENST00000498124 PRDM2Q13029 1718 aa42.03■■■■■ 4.32
CDKN2A-208ENST00000498124 TOPBP1Q92547 1522 aa41.59■■■■■ 4.25
CDKN2A-208ENST00000498124 IFT140Q96RY7 1462 aa41.51■■■■■ 4.24
CDKN2A-208ENST00000498124 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
CDKN2A-208ENST00000498124 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.46■■■■■ 4.23
CDKN2A-208ENST00000498124 ABCC8Q09428 1581 aa41.44■■■■■ 4.22
CDKN2A-208ENST00000498124 OSCARQ8IYS5 282 aa41.34■■■■■ 4.21
CDKN2A-208ENST00000498124 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
CDKN2A-208ENST00000498124 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
CDKN2A-208ENST00000498124 TRIM41Q8WV44 630 aa41.23■■■■■ 4.19
CDKN2A-208ENST00000498124 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
CDKN2A-208ENST00000498124 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.07■■■■■ 4.16
CDKN2A-208ENST00000498124 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.02■■■■■ 4.16
CDKN2A-208ENST00000498124 CUX1P39880 1505 aa40.98■■■■■ 4.15
CDKN2A-208ENST00000498124 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.95■■■■■ 4.15
CDKN2A-208ENST00000498124 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.93■■■■■ 4.14
CDKN2A-208ENST00000498124 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.93■■■■■ 4.14
CDKN2A-208ENST00000498124 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.93■■■■■ 4.14
CDKN2A-208ENST00000498124 SOGA1O94964 1423 aa40.92■■■■■ 4.14
CDKN2A-208ENST00000498124 CHD1O14646 1710 aa40.91■■■■■ 4.14
CDKN2A-208ENST00000498124 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
CDKN2A-208ENST00000498124 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
CDKN2A-208ENST00000498124 ARHGEF11O15085 1522 aa40.82■■■■■ 4.12
CDKN2A-208ENST00000498124 WDR97A6NE52 1622 aa40.81■■■■■ 4.12
CDKN2A-208ENST00000498124 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.69■■■■■ 4.1
CDKN2A-208ENST00000498124 FBLN2P98095 1184 aa40.62■■■■■ 4.09
CDKN2A-208ENST00000498124 GRIN2BQ13224 1484 aa40.58■■■■■ 4.09
CDKN2A-208ENST00000498124 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
CDKN2A-208ENST00000498124 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.5■■■■■ 4.07
CDKN2A-208ENST00000498124 PBRM1Q86U86 1689 aa40.5■■■■■ 4.07
CDKN2A-208ENST00000498124 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.48■■■■■ 4.07
CDKN2A-208ENST00000498124 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.47■■■■■ 4.07
CDKN2A-208ENST00000498124 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.46■■■■■ 4.07
CDKN2A-208ENST00000498124 ARAP1Q96P48 1450 aa40.45■■■■■ 4.07
CDKN2A-208ENST00000498124 SYNJ2O15056 1496 aa40.44■■■■■ 4.06
CDKN2A-208ENST00000498124 SYNJ1O43426 1573 aa40.39■■■■■ 4.06
CDKN2A-208ENST00000498124 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.38■■■■■ 4.06
CDKN2A-208ENST00000498124 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
CDKN2A-208ENST00000498124 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.37■■■■■ 4.05
CDKN2A-208ENST00000498124 TOP2BQ02880 1626 aa40.36■■■■■ 4.05
CDKN2A-208ENST00000498124 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.3■■■■■ 4.04
CDKN2A-208ENST00000498124 ADAMTS12P58397 1594 aa40.14■■■■■ 4.02
CDKN2A-208ENST00000498124 GRIN2AQ12879 1464 aa40.08■■■■■ 4.01
CDKN2A-208ENST00000498124 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.98■■■■□ 3.99
CDKN2A-208ENST00000498124 CEP170Q5SW79 1584 aa39.97■■■■□ 3.99
CDKN2A-208ENST00000498124 NUP160Q12769 1436 aa39.97■■■■□ 3.99
CDKN2A-208ENST00000498124 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.95■■■■□ 3.99
CDKN2A-208ENST00000498124 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.87■■■■□ 3.97
CDKN2A-208ENST00000498124 SHROOM2Q13796 1616 aa39.8■■■■□ 3.96
CDKN2A-208ENST00000498124 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
CDKN2A-208ENST00000498124 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.59■■■■□ 3.93
CDKN2A-208ENST00000498124 KIF27Q86VH2 1401 aa39.49■■■■□ 3.91
CDKN2A-208ENST00000498124 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
CDKN2A-208ENST00000498124 IGF1RP08069 1367 aa39.49■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms