Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA4P13612 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA4P13612 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms