Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ITGA4P13612 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ITGA4P13612 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ITGA4P13612 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ITGA4P13612 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ITGA4P13612 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ITGA4P13612 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ITGA4P13612 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ITGA4P13612 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITGA4P13612 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ITGA4P13612 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ITGA4P13612 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ITGA4P13612 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ITGA4P13612 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGA4P13612 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGA4P13612 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ITGA4P13612 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ITGA4P13612 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ITGA4P13612 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ITGA4P13612 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ITGA4P13612 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ITGA4P13612 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ITGA4P13612 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ITGA4P13612 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGA4P13612 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ITGA4P13612 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITGA4P13612 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITGA4P13612 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGA4P13612 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGA4P13612 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ITGA4P13612 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ITGA4P13612 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGA4P13612 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITGA4P13612 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ITGA4P13612 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ITGA4P13612 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ITGA4P13612 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ITGA4P13612 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ITGA4P13612 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGA4P13612 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGA4P13612 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGA4P13612 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGA4P13612 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
ITGA4P13612 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ITGA4P13612 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITGA4P13612 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGA4P13612 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGA4P13612 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGA4P13612 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGA4P13612 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGA4P13612 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ITGA4P13612 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGA4P13612 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGA4P13612 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITGA4P13612 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ITGA4P13612 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ITGA4P13612 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ITGA4P13612 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ITGA4P13612 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ITGA4P13612 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ITGA4P13612 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGA4P13612 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGA4P13612 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ITGA4P13612 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ITGA4P13612 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGA4P13612 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGA4P13612 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGA4P13612 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGA4P13612 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITGA4P13612 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ITGA4P13612 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ITGA4P13612 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITGA4P13612 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITGA4P13612 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ITGA4P13612 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGA4P13612 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGA4P13612 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGA4P13612 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ITGA4P13612 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGA4P13612 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGA4P13612 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ITGA4P13612 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGA4P13612 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGA4P13612 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGA4P13612 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ITGA4P13612 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGA4P13612 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGA4P13612 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGA4P13612 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ITGA4P13612 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ITGA4P13612 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGA4P13612 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGA4P13612 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ITGA4P13612 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ITGA4P13612 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ITGA4P13612 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGA4P13612 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ITGA4P13612 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ITGA4P13612 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ITGA4P13612 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms