Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.632e-8■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 ERRFI1-205ENST00000487559 787 ntTSL 224.88■■□□□ 1.572e-8■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.572e-8■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.512e-8■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 ETV4-207ENST00000586764 581 ntTSL 317.97■□□□□ 0.472e-6■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.12e-7■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 217.4■□□□□ 0.384e-7■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 MATR3-225ENST00000514528 532 ntTSL 419.5■□□□□ 0.712e-10■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 MATR3-213ENST00000508689 561 ntTSL 418.15■□□□□ 0.52e-10■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 MATR3-210ENST00000504643 2560 ntTSL 28.76□□□□□ -1.012e-10■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 SEPT2-210ENST00000420786 539 ntTSL 521.9■■□□□ 1.14e-14■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 ANO10-206ENST00000427171 746 ntTSL 518.48■□□□□ 0.553e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 ANO10-208ENST00000428831 641 ntTSL 518.26■□□□□ 0.513e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 ANO10-209ENST00000436073 497 ntTSL 418.26■□□□□ 0.513e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 ANO10-211ENST00000444344 575 ntTSL 317.86■□□□□ 0.453e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.343e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.343e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.343e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.243e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 ANO10-214ENST00000456438 545 ntTSL 414.96□□□□□ -0.013e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.123e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 ANO10-207ENST00000428472 592 ntTSL 413.84□□□□□ -0.193e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 ANO10-201ENST00000292246 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.553e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 ANO10-210ENST00000439141 560 ntTSL 46.33□□□□□ -1.43e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 ANO10-204ENST00000413397 511 ntTSL 45.47□□□□□ -1.533e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 SORBS3-210ENST00000520574 699 ntTSL 325.78■■□□□ 1.724e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.44e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 HPN-208ENST00000600390 564 ntTSL 421.47■■□□□ 1.034e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.947e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 SORBS3-205ENST00000518512 755 ntTSL 518.97■□□□□ 0.634e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-228ENST00000618469 718 ntTSL 1 (best)17.74■□□□□ 0.434e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-209ENST00000470026 2108 ntTSL 1 (best)16.15■□□□□ 0.184e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-218ENST00000489037 455 ntTSL 415.65■□□□□ 0.14e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-223ENST00000494123 1612 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.074e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.034e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.214e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-222ENST00000493919 1948 ntTSL 213.56□□□□□ -0.244e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-213ENST00000476777 769 ntTSL 513.24□□□□□ -0.294e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 MTUS1-225ENST00000523718 3354 ntTSL 1 (best)13.21□□□□□ -0.294e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 SMG1P3-205ENST00000522480 4262 ntBASIC11.2□□□□□ -0.624e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-227ENST00000591849 563 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.654e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-219ENST00000491747 2379 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.694e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-226ENST00000591534 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.74e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-205ENST00000461221 5693 ntTSL 1 (best)10.36□□□□□ -0.754e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-207ENST00000461798 582 ntTSL 310.24□□□□□ -0.774e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.944e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.954e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-208ENST00000468300 3273 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -14e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-224ENST00000497488 779 ntTSL 1 (best)8.66□□□□□ -1.024e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-214ENST00000477152 1980 ntTSL 1 (best)8.14□□□□□ -1.114e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-230ENST00000634433 2534 ntTSL 58.07□□□□□ -1.124e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.134e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-215ENST00000478531 1972 ntTSL 1 (best)7.5□□□□□ -1.214e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.344e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-220ENST00000492859 1584 ntTSL 1 (best)5.29□□□□□ -1.564e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.014e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.181e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.611e-8■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 TMEM242-202ENST00000400788 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.666e-7■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 WDR59-214ENST00000568323 558 ntTSL 519.5■□□□□ 0.712e-9■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 WDR59-211ENST00000564859 488 ntTSL 318.82■□□□□ 0.62e-9■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.282e-9■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 WDR59-223ENST00000616369 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-9■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 WDR59-204ENST00000562331 570 ntTSL 411.13□□□□□ -0.632e-9■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.291e-7■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.451e-7■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.51e-7■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.521e-7■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.5■■□□□ 1.517e-7■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.342e-6■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.114e-10■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.171e-6■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 CBX4-204ENST00000495122 490 ntTSL 317.94■□□□□ 0.462e-9■■■□□ 16.5
GTF2F1P35269 TMC6-214ENST00000590162 517 ntTSL 216.67■□□□□ 0.266e-22■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 DVL1-206ENST00000632445 785 ntTSL 527.82■■■□□ 2.043e-9■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 LINC01287-202ENST00000453187 430 ntTSL 311.83□□□□□ -0.524e-9■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 MAGI1-207ENST00000470990 2138 ntTSL 1 (best)9.04□□□□□ -0.969e-9■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 FN3K-204ENST00000573841 513 ntTSL 221.47■■□□□ 1.034e-6■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 FN3K-202ENST00000570734 2515 ntTSL 517.82■□□□□ 0.444e-6■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 SNRPA-211ENST00000601545 695 ntTSL 523.48■■□□□ 1.354e-6■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.014e-6■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 SNRPA-210ENST00000601393 969 ntTSL 318.4■□□□□ 0.544e-6■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.222e-8■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.732e-8■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 TERF2-208ENST00000567841 554 ntTSL 49.67□□□□□ -0.862e-8■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.474e-13■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 TCF25-207ENST00000562256 1879 ntTSL 1 (best)21.76■■□□□ 1.072e-7■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 CTBP2-206ENST00000460976 603 ntTSL 529.5■■■□□ 2.312e-6■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.982e-6■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.62■□□□□ 0.416e-7■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 VEGFA-216ENST00000512683 475 ntTSL 1 (best)14.23□□□□□ -0.139e-23■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 ACSL3-209ENST00000535678 560 ntTSL 322.55■■□□□ 1.28e-8■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.538e-8■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.418e-8■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 ACSL3-204ENST00000413316 650 ntTSL 410.71□□□□□ -0.698e-8■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 SRCIN1-211ENST00000612431 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)25.03■■□□□ 1.65e-6■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.642e-8■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.442e-8■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.426e-7■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 RALGDS-211ENST00000482648 5596 ntTSL 216.3■□□□□ 0.22e-7■■■□□ 16.4
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 267.8 ms