Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.179e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.29e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.249e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.249e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.249e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.249e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-212ENST00000529386 924 ntTSL 1 (best)13.56□□□□□ -0.249e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-218ENST00000533915 899 ntTSL 1 (best)13.56□□□□□ -0.249e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.249e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.279e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 KLF3-202ENST00000482150 517 ntTSL 213.39□□□□□ -0.279e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 TMEM254-210ENST00000472622 824 ntTSL 213.3□□□□□ -0.289e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.329e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PDLIM2-213ENST00000448520 894 ntTSL 312.99□□□□□ -0.339e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 SCAMP5-208ENST00000564779 516 ntTSL 412.94□□□□□ -0.349e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.382e-12■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.389e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.399e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MVK-202ENST00000392727 1770 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.419e-13■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 C1orf198-203ENST00000470540 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CLSTN3-205ENST00000535452 533 ntTSL 412.2□□□□□ -0.469e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 SYNGAP1-224ENST00000637721 190 ntTSL 512.19□□□□□ -0.469e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 KCTD10-216ENST00000545759 5355 ntTSL 1 (best)12.17□□□□□ -0.462e-12■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.479e-13■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CENPI-203ENST00000403304 622 ntTSL 312.03□□□□□ -0.489e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 VPS45-211ENST00000535106 2695 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.519e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 AAAS-206ENST00000547238 1154 ntTSL 211.68□□□□□ -0.541e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 VPS45-212ENST00000611412 2064 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.569e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-203ENST00000333001 883 ntTSL 1 (best)11.51□□□□□ -0.579e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.589e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 NLGN4Y-201ENST00000339174 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)11.29□□□□□ -0.64e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PPP2R5C-209ENST00000553890 492 ntTSL 310.88□□□□□ -0.679e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CLSTN3-209ENST00000539982 570 ntTSL 410.74□□□□□ -0.699e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-215ENST00000531885 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.79e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-216ENST00000533078 565 ntTSL 1 (best)10.65□□□□□ -0.79e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-211ENST00000528484 726 ntTSL 1 (best)10.65□□□□□ -0.79e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-206ENST00000457188 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.79e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 AAAS-203ENST00000546393 832 ntTSL 510.49□□□□□ -0.731e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MVK-209ENST00000540353 4109 ntTSL 210.14□□□□□ -0.799e-13■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 AAAS-207ENST00000547520 769 ntTSL 310.12□□□□□ -0.791e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 WDFY3-AS2-201ENST00000318186 1594 ntTSL 210.03□□□□□ -0.89e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 TMEM254-205ENST00000372281 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.829e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PRPF40B-204ENST00000527253 742 ntTSL 39.72□□□□□ -0.859e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PPP2R5C-212ENST00000554442 800 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.859e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CKLF-CMTM1-201ENST00000527729 585 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.879e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CKLF-CMTM1-205ENST00000615332 395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.889e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 VPS45-202ENST00000369130 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.889e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 TTLL4-211ENST00000448224 583 ntTSL 59.53□□□□□ -0.889e-7■■■■□ 24.1
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PCBP2Q15366 AAAS-208ENST00000547757 949 ntTSL 29.46□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 TMEM254-211ENST00000476173 785 ntTSL 49.44□□□□□ -0.99e-7■■■■□ 24.1
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PCBP2Q15366 C1orf198-202ENST00000427697 3666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.923e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 TMEM254-201ENST00000372273 2074 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.959e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 VPS45-201ENST00000369128 2224 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.999e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 TMEM254-209ENST00000467529 1963 ntTSL 1 (best)8.84□□□□□ -0.999e-7■■■■□ 24.1
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PCBP2Q15366 TMEM254-203ENST00000372275 860 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.049e-7■■■■□ 24.1
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PCBP2Q15366 CMTM1-210ENST00000528441 979 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.059e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-208ENST00000479381 995 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.059e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 LPCAT4-207ENST00000567507 672 ntTSL 38.45□□□□□ -1.069e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 AGAP1-206ENST00000418654 826 ntTSL 38.42□□□□□ -1.069e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 ZBTB18-202ENST00000622512 3740 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.099e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.14e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 TTLL4-220ENST00000491899 589 ntTSL 48.13□□□□□ -1.119e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MICU3-204ENST00000519044 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.11□□□□□ -1.119e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-214ENST00000530141 880 ntTSL 1 (best)8.06□□□□□ -1.129e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 NLGN4Y-202ENST00000355905 5167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)7.81□□□□□ -1.164e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CDON-205ENST00000531586 624 ntTSL 57.7□□□□□ -1.189e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 TMEM254-207ENST00000463029 847 ntTSL 1 (best)7.51□□□□□ -1.219e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 NLGN4Y-204ENST00000382872 6617 ntTSL 1 (best)7.45□□□□□ -1.224e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.229e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 SUSD6-203ENST00000556993 608 ntTSL 37.2□□□□□ -1.269e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 SLC2A9-212ENST00000512342 967 ntTSL 37.14□□□□□ -1.279e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 TMEM254-206ENST00000450179 719 ntTSL 36.83□□□□□ -1.329e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CKLF-CMTM1-203ENST00000529718 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 26.72□□□□□ -1.339e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PPP2R5C-215ENST00000556068 3363 ntTSL 26.68□□□□□ -1.349e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 STX6-202ENST00000469135 4842 ntTSL 1 (best)6.64□□□□□ -1.359e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 VPS45-203ENST00000419023 977 ntTSL 36.53□□□□□ -1.369e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 SLC2A9-205ENST00000503803 644 ntTSL 36.51□□□□□ -1.379e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.439e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 KANSL1L-204ENST00000428655 1510 ntTSL 1 (best)6.09□□□□□ -1.449e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-220ENST00000534143 781 ntTSL 1 (best)5.94□□□□□ -1.469e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 LMBR1-216ENST00000477983 605 ntTSL 25.57□□□□□ -1.529e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 SYNGAP1-218ENST00000636905 123 ntTSL 55.48□□□□□ -1.539e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.25□□□□□ -1.579e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 SLC2A9-210ENST00000508585 398 ntTSL 35.23□□□□□ -1.579e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-207ENST00000465057 797 ntTSL 1 (best)5.18□□□□□ -1.589e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PPP2R5C-213ENST00000554504 448 ntTSL 35.05□□□□□ -1.69e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CENPI-205ENST00000435570 390 ntTSL 34.88□□□□□ -1.639e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 SON-205ENST00000421541 1151 ntTSL 1 (best)4.68□□□□□ -1.669e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CDON-209ENST00000534818 459 ntTSL 34.58□□□□□ -1.689e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.769e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 STXBP1-214ENST00000635950 2771 ntTSL 519.81■□□□□ 0.761e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.211e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 STXBP1-217ENST00000637060 3825 ntTSL 512.84□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.461e-6■■■■□ 24.1
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