RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617710.4

LPCAT4-209, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LPCAT4, Length 1,719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4-209ENST00000617710 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.91■■■□□ 2.86
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LPCAT4-209ENST00000617710 ABCC9O60706 1549 aa28.4■■■□□ 2.14
LPCAT4-209ENST00000617710 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
LPCAT4-209ENST00000617710 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.44■■□□□ 1.98
LPCAT4-209ENST00000617710 NACADO15069 1562 aa27.35■■□□□ 1.97
LPCAT4-209ENST00000617710 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.34■■□□□ 1.97
LPCAT4-209ENST00000617710 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.24■■□□□ 1.95
LPCAT4-209ENST00000617710 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.2■■□□□ 1.95
LPCAT4-209ENST00000617710 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.79■■□□□ 1.88
LPCAT4-209ENST00000617710 SCRIBQ14160 1630 aa26.67■■□□□ 1.86
LPCAT4-209ENST00000617710 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.851e-6■■□□□ 13.4
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LPCAT4-209ENST00000617710 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.21■■□□□ 1.79
LPCAT4-209ENST00000617710 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.93■■□□□ 1.74
LPCAT4-209ENST00000617710 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
LPCAT4-209ENST00000617710 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.69■■□□□ 1.7
LPCAT4-209ENST00000617710 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.67■■□□□ 1.7
LPCAT4-209ENST00000617710 SMARCA4P51532 1647 aa25.51■■□□□ 1.67
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LPCAT4-209ENST00000617710 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.31■■□□□ 1.64
LPCAT4-209ENST00000617710 SMARCA2P51531 1590 aa25.26■■□□□ 1.63
LPCAT4-209ENST00000617710 NCAPD3P42695 1498 aa25.25■■□□□ 1.63
LPCAT4-209ENST00000617710 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.24■■□□□ 1.63
LPCAT4-209ENST00000617710 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
LPCAT4-209ENST00000617710 HMGXB3Q12766 1538 aa25.14■■□□□ 1.62
LPCAT4-209ENST00000617710 WIZO95785 1651 aa25.14■■□□□ 1.62
LPCAT4-209ENST00000617710 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
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LPCAT4-209ENST00000617710 NESP48681 1621 aa24.65■■□□□ 1.54
LPCAT4-209ENST00000617710 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.57■■□□□ 1.52
LPCAT4-209ENST00000617710 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.54■■□□□ 1.52
LPCAT4-209ENST00000617710 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.53■■□□□ 1.52
LPCAT4-209ENST00000617710 CFTRP13569 1480 aa24.44■■□□□ 1.5
LPCAT4-209ENST00000617710 ERCC6Q03468 1493 aa24.43■■□□□ 1.5
LPCAT4-209ENST00000617710 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.36■■□□□ 1.49
LPCAT4-209ENST00000617710 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.35■■□□□ 1.49
LPCAT4-209ENST00000617710 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.26■■□□□ 1.47
LPCAT4-209ENST00000617710 PRDM2Q13029 1718 aa24.26■■□□□ 1.47
LPCAT4-209ENST00000617710 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
LPCAT4-209ENST00000617710 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.2■■□□□ 1.46
LPCAT4-209ENST00000617710 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.12■■□□□ 1.45
LPCAT4-209ENST00000617710 CUX2O14529 1486 aa24.06■■□□□ 1.44
LPCAT4-209ENST00000617710 WDR62O43379 1518 aa24.05■■□□□ 1.44
LPCAT4-209ENST00000617710 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
LPCAT4-209ENST00000617710 TOPBP1Q92547 1522 aa23.9■■□□□ 1.42
LPCAT4-209ENST00000617710 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.87■■□□□ 1.41
LPCAT4-209ENST00000617710 ABCC8Q09428 1581 aa23.84■■□□□ 1.41
LPCAT4-209ENST00000617710 CUX1P39880 1505 aa23.81■■□□□ 1.4
LPCAT4-209ENST00000617710 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
LPCAT4-209ENST00000617710 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
LPCAT4-209ENST00000617710 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.69■■□□□ 1.38
LPCAT4-209ENST00000617710 SYNJ1O43426 1573 aa23.68■■□□□ 1.38
LPCAT4-209ENST00000617710 IFT140Q96RY7 1462 aa23.67■■□□□ 1.38
LPCAT4-209ENST00000617710 TOP2BQ02880 1626 aa23.64■■□□□ 1.37
LPCAT4-209ENST00000617710 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
LPCAT4-209ENST00000617710 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.63■■□□□ 1.37
LPCAT4-209ENST00000617710 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.63■■□□□ 1.37
LPCAT4-209ENST00000617710 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
LPCAT4-209ENST00000617710 SOGA1O94964 1423 aa23.6■■□□□ 1.37
LPCAT4-209ENST00000617710 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
LPCAT4-209ENST00000617710 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.351e-6■■■■■ 35.5
LPCAT4-209ENST00000617710 WDR97A6NE52 1622 aa23.49■■□□□ 1.35
LPCAT4-209ENST00000617710 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LPCAT4-209ENST00000617710 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.45■■□□□ 1.34
LPCAT4-209ENST00000617710 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.36■■□□□ 1.33
LPCAT4-209ENST00000617710 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.34■■□□□ 1.33
LPCAT4-209ENST00000617710 GRIN2BQ13224 1484 aa23.29■■□□□ 1.32
LPCAT4-209ENST00000617710 PBRM1Q86U86 1689 aa23.29■■□□□ 1.32
LPCAT4-209ENST00000617710 TRIM41Q8WV44 630 aa23.27■■□□□ 1.32
LPCAT4-209ENST00000617710 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.26■■□□□ 1.31
LPCAT4-209ENST00000617710 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
LPCAT4-209ENST00000617710 CHD1O14646 1710 aa23.18■■□□□ 1.3
LPCAT4-209ENST00000617710 KIF27Q86VH2 1401 aa23.17■■□□□ 1.3
LPCAT4-209ENST00000617710 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.16■■□□□ 1.3
LPCAT4-209ENST00000617710 FBLN2P98095 1184 aa23.16■■□□□ 1.3
LPCAT4-209ENST00000617710 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.13■■□□□ 1.29
LPCAT4-209ENST00000617710 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.13■■□□□ 1.29
LPCAT4-209ENST00000617710 SYNJ2O15056 1496 aa23.13■■□□□ 1.29
LPCAT4-209ENST00000617710 OSCARQ8IYS5 282 aa23.12■■□□□ 1.29
LPCAT4-209ENST00000617710 ADAMTS12P58397 1594 aa23.11■■□□□ 1.29
LPCAT4-209ENST00000617710 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.1■■□□□ 1.29
LPCAT4-209ENST00000617710 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
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LPCAT4-209ENST00000617710 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.05■■□□□ 1.28
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LPCAT4-209ENST00000617710 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.93■■□□□ 1.26
LPCAT4-209ENST00000617710 CEP170Q5SW79 1584 aa22.92■■□□□ 1.26
LPCAT4-209ENST00000617710 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT4-209ENST00000617710 NUP160Q12769 1436 aa22.9■■□□□ 1.26
LPCAT4-209ENST00000617710 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
LPCAT4-209ENST00000617710 EEA1Q15075 1411 aa22.82■■□□□ 1.24
LPCAT4-209ENST00000617710 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.82■■□□□ 1.24
LPCAT4-209ENST00000617710 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.81■■□□□ 1.24
LPCAT4-209ENST00000617710 PRXQ9BXM0 1461 aa22.8■■□□□ 1.24
LPCAT4-209ENST00000617710 ARHGEF11O15085 1522 aa22.79■■□□□ 1.24
LPCAT4-209ENST00000617710 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.76■■□□□ 1.23
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